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高拷贝数的质粒可以通过其较大的数量来保证它的稳定传代，但是低拷贝数的质粒只能依靠其他的方式。其中有一种被称为主动分配机制，含有分配位点。它由两个反式作用蛋白和一个顺式作用类着丝粒位点组成。其中一个蛋白是ATPase，另外一个蛋白是DNA结合蛋白，能够结合到顺式作用位点。并且与ATPase共同作用，形成分配复合物，来介导分配过程。