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基于字符和0/1码的DNA压缩模式匹配算法
基于字符和0/1码的DNA压缩模式匹配算法
来源 :计算机应用研究 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huangwily
【摘 要】
:
分析对DNA序列数据进行压缩和压缩模式匹配的重要性,采用0/1编码的非自适应算法进行压缩,提出两类压缩模式匹配思路,设计实现了四种算法,并进行了性能比较。
【作 者】
:
张丽霞
张义青
林丕源
刘吉平
【机 构】
:
华南农业大学计算机科学与工程系,华南农业大学动物科学学院
【出 处】
:
计算机应用研究
【发表日期】
:
2007年09期
【关键词】
:
DNA序列
数据压缩
压缩模式匹配
DNA sequence
data compression
compressed pattern matching
【基金项目】
:
国家自然科学基金资助项目(60573043),华南农业大学新学科扶持基金资助项目(4900-K03208,5600-K04098).
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分析对DNA序列数据进行压缩和压缩模式匹配的重要性,采用0/1编码的非自适应算法进行压缩,提出两类压缩模式匹配思路,设计实现了四种算法,并进行了性能比较。
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