【摘 要】
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目的 通过全转录组测序分析比较野生型A549细胞和顺铂耐药A549细胞(A549/DPP)表达谱的差别,揭示非小细胞肺癌(NSCLC)顺铂耐药潜在机制.方法 首先建立A549/DDP细胞系,对A549和
【机 构】
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南京医科大学附属淮安第一医院胸外科 江苏淮安223001;南京医科大学第一附属医院胸外科 南京210029
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目的 通过全转录组测序分析比较野生型A549细胞和顺铂耐药A549细胞(A549/DPP)表达谱的差别,揭示非小细胞肺癌(NSCLC)顺铂耐药潜在机制.方法 首先建立A549/DDP细胞系,对A549和A549/DDP进行全转录组测序,分别对lncRNA-seq,circRNA-seq和miRNA-seq数据进行差异表达以及功能富集分析(KEGG和GO分析).然后进行全转录组数据联合分析以及ceRNA网络的构建.结果 与A549细胞系相比,其中4 517个lncRNA、123个circRNA以及145个miRNA在A549/DDP细胞中有差异表达.显著富集在与癌症相关的通路上.miRNA-circRNA-lncRNA-mRNA 四元网络包含了12个miRNA,4个circRNA,23个lncRNA 和9个mRNA节点.经过拓扑学性质分析hsa-miR-125a-5p和hsa-miR-125b-5p是顺铂耐药相关的关键miRNA.结论 肿瘤坏死因子信号通路和p53信号通路参与了A549/DPP耐药机制.Hsa-miR-125a-5p和hsa-miR-125b-5p可能是逆转顺铂抗性的潜在靶点.
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