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目的 获取毛重楼Paris mairei叶绿体基因组信息特征并对其系统位置进行研究.方法 采用Illumination测序技术对毛重楼叶绿体基因组进行测序,对其进行组装、注释和特征分析,并构建最大似然(maximum likelihood,ML)系统发育树.结果 毛重楼叶绿体基因组大小为163 918 bp,总GC含量为37.05％,大单拷贝区(large single-copy,LSC)、小单拷贝区(small single-copy region,SSC)分别为84 173、13 054 bp,反向互补重复区(inverted repeats,IR)大小为33296 bp,共编码113个基因,包括79个蛋白质编码基因,30个tRNA基因和4个rRNA基因.在系统进化树中,重楼属Paris L.与藜芦科(Melanthiaceae Batsch ex Borkh.)关系较近,与百合科(Liliaceae Juss.)关系较远.结论 LSC区和SSC区序列变异高于IR区;相较于重楼属,毛重楼与蚤休组的亲缘关系最近,应将毛重楼归属为蚤休组;相较于百合科,毛重楼与藜芦科藜芦属亲缘关系更近,应将蚤休组从百合科中独立,归属为藜芦科.