为了解阿勒泰地区额尔齐斯河和乌伦古河流域的鱼类多样性现状和历史演变,本研究于2013–2016年间在该流域的鱼类多样性进行了连续调查,并结合历史资料和标本,以Margalef丰富度指数、Shannon-Wiener多样性指数、Pielou均匀度指数分析评估了流域内鱼类的多样性水平和时空变化。该流域历史上分布有土著鱼类23种,当前记录到19种,流域内还有外来鱼类15种。阿勒泰鱼类的区系组成以鲤科种类为主,其中特有和珍稀濒危物种占比高,具有重要的保护价值。多样性指数计算结果显示,2013–2016年鱼类多样性情况整体稳定,额尔齐斯河鱼类物种数多于乌伦古河。研究还基于鱼类生物完整性指数(Fish Index of Biological Integrity, F-IBI)对34个采集点的河流健康状况进行了评价,结果显示额尔齐斯河流域大多数调查点的健康状况处于"亚健康"或"一般"水平,乌伦古河流域多数调查点的健康状况处于"健康"水平。水利工程、外来物种、过度捕捞是影响阿勒泰地区鱼类多样性的重要因素。未来应通过水利工程的联合调度、下泄合理生态流量、布设鱼类通道、规范养殖渔业、严控外来物种、本地土著鱼类的人工增殖放流,以及合理的就地保护措施对阿勒泰地区的鱼类多样性加以保护,提升水体健康程度。