生物信息学分析TP53基因在肝癌中的表达及其对预后的影响

来源 :中华肝脏外科手术学电子杂志 | 被引量 : 2次 | 上传用户:djlmail
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目的 利用在线数据库探讨TP53在肝细胞癌(肝癌)中的表达及其对预后的影响。方法 利用Sangerbox Tools平台分析TP53基因在常见肿瘤中的表达;UALCAN数据库分析TP53基因与肝癌患者临床特征的关系;Kaplan-Meier Plotter数据库分析TP53表达与肝癌患者预后的关系;CBioPortal数据库分析TP53基因突变和表达改变对肝癌患者生存预后的影响。生存分析采用Kaplan-Meier法和Log-rank检验。结果 Sangerbox Tools平台分析显示,肝癌中TP53基因表达明显高于正常肝组织(P<0.001)。UALCAN数据库和CBioPortal数据库分析显示,在美国癌症联合委员会(AJCC)分期Ⅰ、Ⅲ期,肝癌组织学分级1、3级和2、3级中,TP53表达差异有统计学意义(P=0.024,<0.001,0.012);TP53表达与性别有关,女性患者中TP53表达明显升高(P=0.013)。CBioPortal数据库分析发现,TP53基因突变率与肝癌组织学分级有关,随着组织学分级增加突变率升高(P<0.001)。UALCAN数据库分析显示,低表达TP53的患者总体生存更好(P=0.019)。CBioPortal数据库分析显示,TP53基因无突变患者的总体生存、疾病特异性生存、无进展生存、无病生存明显优于TP53基因突变的患者(HR=8.002,6.592,5.591,5.618;P<0.05)。结论 在线数据库分析发现,TP53在肝癌中高表达,TP53表达水平与肝癌患者临床特征和预后相关,低表达患者预后好,TP53基因无突变患者预后好。
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