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[目的]探讨桑椹色素代谢调控的分子机理。[方法]本研究以桑科植物的 EST数据库为基础，采用生物信息学实验技术，通过电子克隆方法获得了桑树查尔酮合成酶基因(CHS)。采用生物信息学在线软件，进一步对该基因编码蛋白的氨基酸组成、理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、亚细胞定位、高级结构等方面进行了预测和分析。[结果]经 DNAstar软件拼接后得到的 cDNA序列为1365 bp，其开放阅读框序列为1170 bp，编码389个氨基酸残基。 CHS 蛋白含有查尔酮合酶家族的特征多肽序列 RLMMYQQGCFAGGTVLR，不含信号肽序列，属于非分泌型蛋白，定位于细胞质内，分子进化也较为保守。[结论]该研究结果为深入研究该蛋白的结构和功能奠定了基础。