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北京四中一贯重视教育科学研究，研究使我们能够不断提出和发现问题，总结经验，解决继承传统与改革创新过程中出现的问题，保持较高的办学水平。北京四中教育科研管理的特点是：关注实效，激发教师自主研究意识，提高教师自主研究能力，让研究更多地成为老师的一种自发的常态行为，形成了独特的学校教育科研文化。
■ 校本研究的管理组织体系
学校校本教科研工作的核心管理组织是“北京四中教育科学研究室”。研究室成员由北京四中校长、教学处领导和在校教师构成，每学年聘任一次。教科研室始终坚持兼职、自助式的组织形式。这种组织形式非常有利于把研究和学校工作融合在一起，大大增加科研的实效性。我们还坚持教科研室成员覆盖所有学科，这样既保证了每组都有校本教研骨干，又保证了教科研室工作的落实。
“十一五”期间，我们进一步扩大了成员范围，吸收了部分初中骨干教师和更年轻的骨干教师，成员从“十五”期间的13人增加到23人。大家讨论研究，就教科研室的功能定位、工作方针、目标和具体任务达成了共识。
工作方针——坚持科研为教育教学和管理实践服务，努力营造科研的氛围，使学校教科研工作真正融入教育、教学和管理的各项工作中。
具体定位——学校教科研事务的服务和管理部门、学校发展的“智力库”、教师发展的学术指导机构。
基本工作目标——推动学校发展，促进教师专业发展。通过科研减轻教师压力，帮助教师突破“高原期”，努力为教师搭建专业成长的平台。
具体任务——为全体教职工专业发展服务；为教师专业发展提供咨询，为学校发展提出建议；决定学校科研方面事务；评审校级课题、论文、成果等；提高教师的发展能力，特别是研究能力；培养教科室成员的学术领导能力等。
■ 多层次、多主体参与的课题研究体系
各级研究课题的选题、申报、研究、管理、结题和推广是学校科研操作的基本平台。北京四中形成了学校、部门、教研组、年级组、教师个人多层面的研究体系。
学校鼓励教师积极承担或参与国家级、市级和区级教育科研课题的研究，并在科研课题的立项、实验、评审、推广等方面，提供一定的经费支持及其他物质帮助。
学校特别重视并引导教师研究学校工作中急需解决的问题，2006年，公布了“十一五”《北京四中教育科研课题指南》，并于2007年启动了校级课题的申报和评审工作。
2009年3月，学校又启动了第二轮校级课题的申报和评审工作，这批校级课题可获得经费资助。这极大调动了一线教师和教育教学管理人员开展校本研究的热情。全校共22个课题申报立项，新项目涉及教师83人次。评审工作首次采取评委依据标准打分的形式，比较客观公正。学校教科研向定量规范管理迈出了第一步。
2010年，学校又用“基础教育国际化背景下优质学校的基本特征、建设与发展的理论与实践研究项目”专项经费，以招标的方式，向每个课题拨出经费，大力鼓励教师申报新的基金资助课题。课题审批工作由学校教科研室负责，我们继续采取投票评议的方法，保证了课题审批的科学合理。实践证明，这些做法更大地激发了一线教师和教育教学管理人员进行校本研究的热情。教职工踊跃申报校级课题，课题主持人中既有校长、主任、教研组长，也有80后青年教师。一些职能部门，如图书馆、办公室、外事部门等也开始申报课题。
对于校级课题，我们注重过程管理：要求教师每学期结合自己的课题研究，至少报送一节公开研究课，教科研室组织听课、评课并给予奖励，优秀课录像片段在全校大会上播放并点评；立项课题进行定期检查，一年的课题在年中进行一次检查，两年或两年以上的课题每年进行一次中期检查。
■ 尝试丰富、有效的研究活动方式
1.各种科研例会制度
教科研室工作例会。每月一次，讨论全校的校本研究各项工作，汇报交流研究进展和各项评比工作。
教研组理论学习。每学期至少三次，由于各学科都有教师是教科研室成员，这样就保证了每组都有校本教研骨干，教科研室工作可以得到有效落实。
课题例会。时间由课题组自定，学校提供地点和经费保障，教科研室组织。这些例会多是轻松、热烈的沙龙形式，教师们或深思或讨论，有时是激烈辩论，往往从下午一直讨论到晚上。这种轻松和谐的研讨形式是我校的特色之一。
2.全校范围的校本教研培训制度
基本形式有两种：一是每学期每周的全校大会，一般都有三次以上是专门进行校本研究，如专家报告、优秀课点评、优秀论文点评等；二是利用校园网的教育科研主页向全校发布各种研究信息和培训材料，还开通了网络点播和评课系统，为校本研究提供交流、研讨和推广的机会。
3.科研成果总结和推广制度
每学年的论文征集和评选。学校要求教师每学年上交一篇教学研究论文，正副班主任还要提交一篇德育论文。教科研室组织评审，公布奖项并在全校讲评，请获优秀论文奖的教师发言。
教学研讨会和德育研讨会。每学年分别召开教学研讨会和德育研讨会，为教师提供展示平台，并交流问题，促进提高。
优秀课题成果评选。这是全校教育科研最高级别的奖励，优秀教育科研成果奖设特等奖、一等奖、二等奖、三等奖，评奖工作采取作者申请、评审组评选、校长办公会审定批准的方式。获奖成果及其等级公示后无异议，学校颁发证书并予以表彰。
近年来，北京四中在科研上取得了较为丰富的成果。据CNKI（同方知网公司）2010年9月提供的数据显示，2000年～2010年全国中学（统计1004家）总发文和总被引排名，北京四中总发文数563篇，居全国第14位，北京第1位，总被引频次367，居全国第2位。2008年至今，四中的教育科研成果多次获得国家、市区奖励。2010年7月，我校荣获教育部中国教师发展基金会颁发的全国“十一五”教育科研先进集体称号，2011年荣获北京市教育科研先进集体称号。
■ 校本研究的管理组织体系
学校校本教科研工作的核心管理组织是“北京四中教育科学研究室”。研究室成员由北京四中校长、教学处领导和在校教师构成，每学年聘任一次。教科研室始终坚持兼职、自助式的组织形式。这种组织形式非常有利于把研究和学校工作融合在一起，大大增加科研的实效性。我们还坚持教科研室成员覆盖所有学科，这样既保证了每组都有校本教研骨干，又保证了教科研室工作的落实。
“十一五”期间，我们进一步扩大了成员范围，吸收了部分初中骨干教师和更年轻的骨干教师，成员从“十五”期间的13人增加到23人。大家讨论研究，就教科研室的功能定位、工作方针、目标和具体任务达成了共识。
工作方针——坚持科研为教育教学和管理实践服务，努力营造科研的氛围，使学校教科研工作真正融入教育、教学和管理的各项工作中。
具体定位——学校教科研事务的服务和管理部门、学校发展的“智力库”、教师发展的学术指导机构。
基本工作目标——推动学校发展，促进教师专业发展。通过科研减轻教师压力，帮助教师突破“高原期”，努力为教师搭建专业成长的平台。
具体任务——为全体教职工专业发展服务；为教师专业发展提供咨询，为学校发展提出建议；决定学校科研方面事务；评审校级课题、论文、成果等；提高教师的发展能力，特别是研究能力；培养教科室成员的学术领导能力等。
■ 多层次、多主体参与的课题研究体系
各级研究课题的选题、申报、研究、管理、结题和推广是学校科研操作的基本平台。北京四中形成了学校、部门、教研组、年级组、教师个人多层面的研究体系。
学校鼓励教师积极承担或参与国家级、市级和区级教育科研课题的研究，并在科研课题的立项、实验、评审、推广等方面，提供一定的经费支持及其他物质帮助。
学校特别重视并引导教师研究学校工作中急需解决的问题，2006年，公布了“十一五”《北京四中教育科研课题指南》，并于2007年启动了校级课题的申报和评审工作。
2009年3月，学校又启动了第二轮校级课题的申报和评审工作，这批校级课题可获得经费资助。这极大调动了一线教师和教育教学管理人员开展校本研究的热情。全校共22个课题申报立项，新项目涉及教师83人次。评审工作首次采取评委依据标准打分的形式，比较客观公正。学校教科研向定量规范管理迈出了第一步。
2010年，学校又用“基础教育国际化背景下优质学校的基本特征、建设与发展的理论与实践研究项目”专项经费，以招标的方式，向每个课题拨出经费，大力鼓励教师申报新的基金资助课题。课题审批工作由学校教科研室负责，我们继续采取投票评议的方法，保证了课题审批的科学合理。实践证明，这些做法更大地激发了一线教师和教育教学管理人员进行校本研究的热情。教职工踊跃申报校级课题，课题主持人中既有校长、主任、教研组长，也有80后青年教师。一些职能部门，如图书馆、办公室、外事部门等也开始申报课题。
对于校级课题，我们注重过程管理：要求教师每学期结合自己的课题研究，至少报送一节公开研究课，教科研室组织听课、评课并给予奖励，优秀课录像片段在全校大会上播放并点评；立项课题进行定期检查，一年的课题在年中进行一次检查，两年或两年以上的课题每年进行一次中期检查。
■ 尝试丰富、有效的研究活动方式
1.各种科研例会制度
教科研室工作例会。每月一次，讨论全校的校本研究各项工作，汇报交流研究进展和各项评比工作。
教研组理论学习。每学期至少三次，由于各学科都有教师是教科研室成员，这样就保证了每组都有校本教研骨干，教科研室工作可以得到有效落实。
课题例会。时间由课题组自定，学校提供地点和经费保障，教科研室组织。这些例会多是轻松、热烈的沙龙形式，教师们或深思或讨论，有时是激烈辩论，往往从下午一直讨论到晚上。这种轻松和谐的研讨形式是我校的特色之一。
2.全校范围的校本教研培训制度
基本形式有两种：一是每学期每周的全校大会，一般都有三次以上是专门进行校本研究，如专家报告、优秀课点评、优秀论文点评等；二是利用校园网的教育科研主页向全校发布各种研究信息和培训材料，还开通了网络点播和评课系统，为校本研究提供交流、研讨和推广的机会。
3.科研成果总结和推广制度
每学年的论文征集和评选。学校要求教师每学年上交一篇教学研究论文，正副班主任还要提交一篇德育论文。教科研室组织评审，公布奖项并在全校讲评，请获优秀论文奖的教师发言。
教学研讨会和德育研讨会。每学年分别召开教学研讨会和德育研讨会，为教师提供展示平台，并交流问题，促进提高。
优秀课题成果评选。这是全校教育科研最高级别的奖励，优秀教育科研成果奖设特等奖、一等奖、二等奖、三等奖，评奖工作采取作者申请、评审组评选、校长办公会审定批准的方式。获奖成果及其等级公示后无异议，学校颁发证书并予以表彰。
近年来，北京四中在科研上取得了较为丰富的成果。据CNKI（同方知网公司）2010年9月提供的数据显示，2000年～2010年全国中学（统计1004家）总发文和总被引排名，北京四中总发文数563篇，居全国第14位，北京第1位，总被引频次367，居全国第2位。2008年至今，四中的教育科研成果多次获得国家、市区奖励。2010年7月，我校荣获教育部中国教师发展基金会颁发的全国“十一五”教育科研先进集体称号，2011年荣获北京市教育科研先进集体称号。