起译密码子AUG侧翼序列对水稻基因表达水平的影响

来源 :中国农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：SuperMMX

【摘要】

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对541条水稻基因序列测定了其起译密码子AUG侧翼区序列(-20～+6)不同位点的同义密码子偏性及基因表达水平.结果表明,与密码子适应指数(CAI)和密码子偏好指数(CPP)、mRNA丰度呈

【作者】

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刘庆坡谭军薛庆中

【机构】

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浙江大学农业与生物技术学院农学系,杭州华大基因研发中心

【出处】

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中国农业科学

【发表日期】

：

2004年5期

【关键词】

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水稻起译密码子 AUG侧翼序列基因表达同义密码子偏性定点突变模拟 Rice AUG Flanking sequence Codon usage bias

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对541条水稻基因序列测定了其起译密码子AUG侧翼区序列(-20～+6)不同位点的同义密码子偏性及基因表达水平.结果表明,与密码子适应指数(CAI)和密码子偏好指数(CPP)、mRNA丰度呈显著或极显著相关的位点分别有5个(-19、-18、-9、-4和+5)、8个(-19、-18、-14、-9、-6、-4、-1和+5)和7个(-18、-16、-15、-9、-7、-1和+6),其中只有-4和+5位点与CAI和CPP的值正相关,表明上述位点在转录水平上处于有利进化的自然选择压.对高表达的变应原蛋白基因7个特殊

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