【摘 要】
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本研究通过高通量测序,分析低氧胁迫下脊尾白虾(Palaemon carincauda)某些基因的差异表达,获得10.62 Gb高质量测序数据,组装得到155113条转录本和118953条Unigene。注释Unige
【机 构】
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江苏海洋大学海洋科学与水产学院,中国水产科学研究院南海水产研究所广东省渔业生态环境重点实验室
【基金项目】
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江苏省海洋生物技术重点实验室开放基金(HS16005),广东省渔业生态环境重点实验室开放基金(FEEL-2019-3),江苏省大学生实践创新项目(SZ201811641105001,SY201811641105001),连云港市“海燕计划”科研项目共同资助
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本研究通过高通量测序,分析低氧胁迫下脊尾白虾(Palaemon carincauda)某些基因的差异表达,获得10.62 Gb高质量测序数据,组装得到155113条转录本和118953条Unigene。注释Unigene37580条。其中,33659条Unigene与Nr蛋白数据库基因同源;11275条Unigene注释到KEGG数据库,归类到223个代谢通路。低氧胁迫产生1392条差异表达基因,包括311条上调基因和1081条下调基因,784条差异基因得到注释,并富集到抗氧化活性、细胞连接、蛋白结合转录
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