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对5034条西瓜无冗余EST序列进行了搜索,共检索出347个SSR,检出率为6.89%,平均分布距离为7.49kb。包括91种重复基元,其中二核苷酸和三核苷酸重复基元占主导地位,分别占总SSR的39.48%和46.68%。AT是二核苷酸中的优势基元,占二核苷酸重复类型的23.35%。三核苷酸重复基元分布比较分散,优势基元GAA仅占三核苷酸重复类型的8.64%。理论上表明这些EST-SSR具有较高的可用性。