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一种新的蛋白质结构类预测方法
一种新的蛋白质结构类预测方法
来源 :生物信息学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fanrongcheng
【摘 要】
:
基于氨基酸的16种分类模型,给出蛋白质序列的派生序列,进而结合加权拟熵和LZ复杂度构造出34维特征向量来表示蛋白质序列。借助于贝叶斯分类器对同源性不超过25%的640数据集进行
【作 者】
:
李楠
李春
【机 构】
:
渤海大学数理学院
【出 处】
:
生物信息学
【发表日期】
:
2012年4期
【关键词】
:
蛋白质结构类预测
氨基酸
加权拟熵
LZ复杂度
贝叶斯分类器
Prediction of protein structural classes Amino ac
【基金项目】
:
辽宁省高等学校杰出青年学者成长计划(LIQ2011122).
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基于氨基酸的16种分类模型,给出蛋白质序列的派生序列,进而结合加权拟熵和LZ复杂度构造出34维特征向量来表示蛋白质序列。借助于贝叶斯分类器对同源性不超过25%的640数据集进行蛋白质结构类预测,准确度达到71.28%。
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