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苹果EST-SSRs标记开发及其应用于苹果品种遗传多样性分析

来源 :江苏农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：samxustyle

【摘 要】

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该研究旨在分析苹果EST中SSR位点分布规律,开发苹果EST-SSR引物,探究基于EST-SSR的苹果品种遗传差异。从NCBI公共数据库中下载63 708条苹果表达序列标签（Expressed sequence t

【作 者】

：

李荷蓉 王昆 孙欣 张春华 房经贵 

【机 构】

：

南京农业大学园艺学院,中国农业科学院果树研究所,江苏省农业科学院园艺研究所

【出 处】

：

江苏农业学报

【发表日期】

：

2012年1期

【关键词】

：

苹果 EST SSR 遗传多样性 apple  EST  SSR  genetic diversity 

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该研究旨在分析苹果EST中SSR位点分布规律,开发苹果EST-SSR引物,探究基于EST-SSR的苹果品种遗传差异。从NCBI公共数据库中下载63 708条苹果表达序列标签（Expressed sequence tag,EST）,首先利用MI-SA软件进行SSR位点查找,筛选出符合条件的SSR位点,利用Primer 5.0 Plus软件设计49对引物,用非变性聚丙烯酰胺凝胶（PAGE）研究这些SSR引物的PCR扩增产物,总结其特点,并回收部分产物测序,以验证其真实性。结果显示63 708条苹果的EST序列

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