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日本在国家层面对于外资企业实行国民待遇，并无特殊优惠政策，对跨国公司研发机构也同样。日本各地方政府为吸引外资制定地方性优惠政策，对投资超过一定额度、解决一定就业数量或建立研究开发设施的外资企业，采取减免事业税、固定资产税、不动产取得税，对前期调研、租用办公用房或建设用地提供补助等措施，帮助企业顺利开展在日本的筹办业务。