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蛋白质中翻译后修饰蛋白的鉴定是蛋白质组学研究的主要内容之一。毛细管电泳技术由于其高分辨能力、低样品上样量、易操作性和较少的分析时间等特点，迅速发展成为一种重要的分离技术。通过毛细管电泳与质谱连用，可以得到许多关于蛋白质鉴定、纯化和结构改变方面的十分有价值的信息。对毛细管电泳技术进行了简单介绍，并且就其在蛋白质磷酸化和蛋白质糖基化研究中的应用进行了综述。