PCR和HRM两种方法检测细菌耐药基因aac(6′)-Ib-cr的比较研究

来源 :国际检验医学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhoulei1964
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的研究聚合酶链反应(PCR)和高分辨熔解技术(HRM)两种方法检测细菌耐药基因氨基糖苷乙酰转移酶的变异基因(aac(6′)-Ib-cr)检出率的差异性。方法采用PCR方法检测299株临床常见的革兰阴性杆菌的aac(6′)-Ib基因,并以内切酶BtsCI酶切消化aac(6′)-Ib的PCR阳性产物以确定aac(6′)-Ib-cr;同时采用HRM技术检测以上所有菌株的aac(6′)-Ib和aac(6′)-Ib-cr基因。结果 PCR和酶切法共检出aac(6′)-Ib基因29株,其中有21株变异为aac(6′)-Ib-cr,变异率为72.4%(21/29)。而且HRM技术检测的结果与其完全一致。结论 PCR和HRM两种方法检测细菌耐药基因aac(6′)-Ib-cr的能力相当,可以用更简便的HRM技术替代PCR和酶切法检测aac(6′)-Ib-cr基因,尤其适用于大量筛检。 Objective To investigate the difference of the detection rates of aac (6 ’) - Ib-cr between the resistant gene aminoglycoside acetyltransferase and polymerase chain reaction (PCR) and high resolution melting (HRM) . Methods The aac (6 ’) - Ib gene of 299 clinically common Gram - negative bacilli was detected by PCR and the PCR positive products of aac (6’) - Ib were digested with restriction endonucleases BtsCI to determine aac (6 ’ -Ib-cr; aac (6 ’) - Ib and aac (6’) - Ib-cr genes of all the above strains were also detected by HRM technique. Results 29 strains of aac (6 ’) - Ib gene were detected by PCR and digestion. Among them, 21 strains were aac (6’) - Ib-cr with mutation rate of 72.4% (21/29). And HRM technology test results and exactly the same. Conclusion The PCR and HRM methods are comparable in detecting the resistance gene aac (6 ’) - Ib-cr. The simpler HRM technique can be used to detect aac (6’) - Ib-cr gene instead of PCR and restriction enzyme digestion. Especially suitable for mass screening.
其他文献
目的通过PCR反向点杂交技术检测人乳头瘤病毒(HPV),并采用DNA测序法对此方法进行验证,比较两种检测方法的一致性,为临床使用PCR反向点杂交技术进行HPV DNA检测提供准确依据。
目的探讨老年2型糖尿病(T2DM)肾病患者血清胱抑素C(CysC)、脂蛋白(α)[Lp(a)]与尿微量清蛋白/肌酐(UACR)的相关性。方法选取2014年12月至2015年12月该院内分泌科收治的老年T2DM患者102
为了确保复杂条件下山岭隧道的安全出洞,以沪蓉西高速公路夹活岩隧道为例,介绍在施工条件困难、洞口偏压的情况下,利用隧道外侧修筑挡墙缓解偏压,内部小导坑出洞创造工作面,
目的 利用DNA-pool技术对原发性高血压患者进行测序,探索中国原发性高血压患者单核苷酸多态性变异(SNP)情况。方法 连续收集2014年3月至2014年6月深圳市孙逸仙心血管医院的高血
作为一个传统的科教大市,南京拥有丰富的海外智力资源。为充分发挥这一人才优势,2004年南京推出四大计划: