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化学信息学是一门利用信息学、计算机科学和技术来解决化学问题的学科。本文利用Matlab科学计算软件的图形用户界面（GUI）功能,通过分子模拟课堂教学的具体实例来展示图形用户界面在化学信息学课程辅助教学中的优点。交互式图形用户界面使得分子模拟过程直观可视化,通过理论与实践教学的结合有助于提高教学质量,激发学习兴趣。