肺癌是世界范围内排名首位的肿瘤致死疾病,2009年死亡病例数为140万,占所有肿瘤死亡病例的18%。肺癌根据病理形态可以分为小细胞肺癌和非小细胞肺癌,其中非小细胞肺癌占所有肺癌的85%左右。非小细胞肺癌大部分在发现时已经为晚期病例从而失去手术根治的机会,并且其5年生存率只有15%-16%。近年来,对于非小细胞肺癌尤其是肺腺癌的遗传学研究阐明了部分肺癌的发病机理,即肿瘤中存在促使肿瘤发生和维持增殖的“驱动”突变。肿瘤依赖于驱动突变而不断生长,针对特定驱动突变的靶向药物可以使肿瘤产生明显的消退,并显著延长患者无疾病生存期(例如(?)(?)GFR酪氨酸激酶抑制剂)。但是,非小细胞肺癌中有相当部分的病例肿瘤中没有已知的驱动突变,并且癌基因拷贝数的增加也被认为是促使肿瘤发生发展的因素。另外,目前对于肺鳞癌癌基因突变报道很少,很大程度上处于空白。本课题立足于临床非小细胞肺癌样本,采用多种手段检测癌基因突变,融合,拷贝数变化,并通过高通量测序的手段筛选未知的驱动突变基因。本课题研究结果表明在中国人群中90%的不吸烟肺腺癌患者肿瘤有EGFR, KRAS, HER2, ALK和ROSl突变中的一种。有EGFR或HER2的肺腺癌肿瘤患者具有明显的临床病理学特征。同时,驱动突变的突变谱在不吸烟和吸烟的肺腺癌中,以及在肺腺癌和肺鳞癌中差异很大,提示不同的致病机理。我们通过高通量测序的方法对没有已知突变的肺腺癌和大量肺鳞癌样本进行了筛选。目前已经得到了一些候选驱动突变基因,正在对其进行大规模的验证。本课题的研究成果构建了相对完整的肺腺癌突变谱,探讨了EGFR和HER2基因突变和基因拷贝数变化的关系,并通过高通量测序对未知的领域进行了筛查,为今后的深入研究奠定了良好的基础。