重庆地区汉族群体STR基因座遗传多态性及群体遗传结构探究

来源 :重庆医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mhyu
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:对重庆地区汉族群体GoldeneyeTM20A扩增试剂盒中的19个常染色体STR基因座(D8S1179,D21S11,D7S820,CSF1PO,D3S1358,TH0l,D13S317,D16S539,D2S1338,D19S433,vWA,TPOX,D18S51,D5S818,FGA,D6S1043,Penta D,Penta E及D12S391)进行遗传多态性研究,并评价其法医学有效性,进而为我国DNA数据库的建立提供参考数据。基于早期研究的其他群体遗传多样性数据探讨中国不同群体及全球不同群体间遗传关系。方法:收集671例重庆汉族无关个体血样,用Chelex 100法提取DNA,用GoldeneyeTM20A扩增试剂盒进行PCR扩增,然后基于ABI3130遗传分析仪对其进行毛细管电泳分离,用GeneMapper ID 3.2软件进行DNA分型。采用Modified-powerstate软件计算等位基因频率及法医学参数。利用Arlequin Version 3.5软件进行Hardy-Weinberg equilibrium及连锁不平衡检验。基于早期研究的58个中国群体遗传多样性数据,探究中国范围内59个群体的遗传关系。用MVSP软件进行主成分分析,用Arlequin Version 3.5软件分别计算该59个群体间的Nei’s、Cavalli-Sforza及Reynold’s遗传距离,然后基于不同遗传距离用Mega 7.0软件进行系统发生分析,用SPSS软件进行多维尺度分析。进一步整理检索全球主要群体的遗传多样性数据,基于STR探索全球51个群体之间的群体遗传结构及群体关系。用MVSP软件进行主成分分析,用Arlequin Version 3.5软件计算Reynold’s遗传距离,再用Mega 7.0软件、SPSS软件分别进行群体系统发生及多维尺度分析。结果:GoldeneyeTM20A扩增试剂盒中的19个STR基因座均符合Hardy-Weinberg平衡及处于连锁平衡状态。671例重庆汉族无关个体中共检出238个等位基因,等位基因频率分布在0.0007至0.5119范围内,联合个人识别能力及联合非父排除概率分别达到0.9 999 999 999 999999 999 999 895 4及0.99999998387。重庆汉族群体与新疆哈萨克族,维吾尔族群体遗传差异大,而与四川汉族,云贵汉族群体遗传差异小。中国群体不同语系群体存在遗传差异,藏缅语族群体与阿尔泰语系群体各自聚集为簇,中国南方群体与北方群体存在遗传差异,南方群体与北方群体各自聚集为簇。全球群体中来自同一大陆的群体各自聚集为簇,群体间遗传差异较小。结论:GoldeneyeTM20A扩增试剂盒中的19个STR基因座在重庆汉族群体具有高度多态性,适合用于重庆汉族群体法医学中的个人识别及亲权鉴定。中国南方群体与北方群体存在遗传差异,不同语系群体存在遗传差异,藏缅语族群体和阿尔泰语系群体同其它群体间存在显著的遗传结构差异。重庆汉族与少数民族及地理位置相距较远的群体遗传差异大,而与同一民族且地理位置毗邻的群体遗传差异小。全球来自同一大陆的群体间遗传差异较小。群体遗传关系与语言、种族来源及地理位置密切相关。
其他文献
<正>夏秋季猪的常发病除了猪瘟、猪流感、仔猪副伤寒、嗜血杆菌病、腹泻以外,近几年来还流行附红细胞体病和弓形体病等,使夏秋季猪病发生了一些新的变化及特点,因此诊断及防
为进一步开发红叶李资源,筛选其活性成分,通过比较水煮沸、醇回流、超声、微波、闪式、超临界CO2(SFE-CO2)、复合酶酶解等提取方法对红叶李花中总黄酮含量的影响和对α-葡萄糖
<正>本刊讯2019年8月19日,由中国造纸信息网主办,四川省造纸行业协会生活用纸分会协办的2019生活用纸绿色共享发展论坛在成都成功举办。四川省造纸行业协会副会长兼秘书长罗
期刊
大豆是一种重要的农产品,近年来,其产量在美国和全世界都稳定增长。它具有很高的营养价值,其蛋白质和脂肪的含量很高,而且质量也很好。大豆还含有许多微量成分,其健康价值也是独一
粘液纤毛系统是呼吸道防御机制的重要组成部分,通过粘液纤毛系统的清除作用,从气管支气管树中除去吸入的颗粒、内源性细胞碎屑以及过多的分泌物等,以保持呼吸道的正常生理功能。
目的:讨论分析对于颅底存在脊索瘤的患者实行MRI及CT的成像影像特性与其在临床上的价值。方法:选择本院2013年1月至2016年2月间收治的30例颅底存在脊索瘤的患者,并选择同期侵
目的:评价320排640层动态容积CT胸痛三联检查在急性胸痛病因鉴别诊断中的价值。方法:67例急性胸痛患者行320排640层动态容积CT三联检查,同时选择性接受心电图,心脏超声,生化
新能源产业建设如火如茶,新能源汽车补贴政策也成了引导新能源行业发展的风向标。2013年9月,《关于继续开展新能源汽车推广应用工作的通知》出台;2014年2月8日,财政部、科技
本文介绍了驾驶员的心理生理反应特性、产生原因,分析其与道路行车安全的关系,并提出了一定的措施与建议。期望从提高驾驶员素质的角度,减少交通事故的发生。
随着移动互联网技术的飞速发展,微信公众平台已广泛用于医疗领域。为解决我院儿童保健工作中疫苗注射等待时间长,儿童保健优质资源短缺的问题,我院创新网上就诊模式,采用移动