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部分绵羊具有四个或更多的乳头，但有关这一性状的遗传机理研究报道较少。为了探究其遗传差异，本研究对四乳头湖羊基因组进行了重测序分析，筛选出与该性状相关的候选基因。 1、采集四乳头湖羊（试验组）和两乳头湖羊（对照组）血液样本，提取血样DNA进行全基因组重测序，测序结果与绵羊参考基因组（Ovis aries Oar3.1）比对，结果表明: (1)使用GATK算法比对测序结果，查找湖羊基因组的突变位点。其中在基因编码区中，试验组中共有42001个SNP/InDel位点，对照组共有50010个SNP/InDel位点。 (2)对SNP/InDel位点进行维恩分析，得到试验组湖羊特有的SNP/InDel位点39个，提示这些突变位点可能是四乳头性状的潜在关联位点。 (3)对试验组特有的39个SNP/InDel位点进行注释，共计注释到21个基因。并对这21个基因进行GO富集分析和KEGG通路分析，涉及物质代谢、免疫应答、细胞生长、机体发育和信号通路等功能。 2、对湖羊基因组重测序得到试验组中的33个SNP位点进行了验证，利用Sanger测序法和SNaPshot技术对变异位点进行SNP分型，结果表明： (1)与参考基因组对比，33个变异位点中，有18个位点碱基没有发生改变，15个位点发生了碱基变化。其中ZEB1基因中sheep13-32879407位点和DEPDC7基因中sheep15-61871375位点试验组相比于对照组存在较高的突变率。sheep13-32879407G＞C位点在四乳头样本中的突变率为91％，在对照组中的突变率为30％;sheep15-61871375G＞C位点在四乳头样本中的突变率为72％，在对照组中的突变率为29％。 (2)对ZEB1基因的sheep13-32879407G＞C位点与湖羊四乳头发育等级进行关联分析。在总样本中，基因型CC和GC分别比基因型GG个体拥有更高的四乳头等级(P＜0.01)。在试验组中，基因型CC和GC分别比基因型GG个体拥有更高的四乳头等级(P＜0.05)。说明这两个基因型的个体四乳头发育更好。对DEPDC7基因的sheep15-61871375A＞C位点与湖羊四乳头等级进行关联分析。在总样本中，基因型CC和AC分别比基因型GG个体拥有更高的四乳头等级(P＜0.01)，说明这两个基因型个体的四乳头发育更好。 综上所述，ZEB1和DEPDC7基因可作为四乳头性状的候选基因。