GRIK3在胃癌中的表达及临床意义

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目的:谷氨酸受体离子型红藻氨酸3(GRIK3)是谷氨酸受体家族的成员之一,主要参与神经配体受体相互作用通路。之前报道的谷氨酸受体离子型红藻氨酸家族的其他成员主要参与调节肿瘤细胞的增殖、迁移以及转型,然而GRIK3在肿瘤中的作用依然不明确。本研究的目的主要是为了揭示GRIK3在胃癌中的表达及临床意义。  方法:首先利用R语言中的DEseq包和survival包来分析TCGA数据库的胃癌组织中基因的差异表达情况以及生存预后,从而筛选出差异表达的基因,并且利用STRING数据库对TCGA数据库筛选差异表达的基因进行蛋白间相互作用网络分析,然后利用DAVID在线数据库对这些差异表达的基因进行基因的GO功能富集分析以及KEGG通路分析,从而研究它们参与癌症的生物学过程以及功能机制。结合各方面的分析数据筛选出GRIK家族中在胃癌发生发展过程起重要作用的基因。然后利用免疫组织化学对该基因的蛋白表达情况进行验证,并且结合临床病理资料对该基因进一步分析,最后通过单因素和多因素分析筛选出与胃癌预后相关的影响因素。  所有实验数据的分析采用的都是SPSS统计软件(Version20.0,IBM,Chicago,IL,USA).GRIK3的表达和临床病理资料的关系分析使用的是卡方检验。总体生存率的分析使用的是K-M曲线分析,生存曲线之间的差异是通过秩检验来分析的。COX风险回归模型用来进行单因素和多因素分析,从而确定潜在的独立预后影响因素。以上所有的分析结果,p<0.05被认为有统计学意义。  结果:通过差异表达分析发现GRIK家族中只有GRIK2,GRIK3以及GRIK5有差异表达(p<0.05)然而结合生存分析,发现只有GRIK3(P=0.002)和GRIK5(p=0.042)的表达对胃癌的患者生存的影响。另外,通过蛋白间互作网络分析以及子网络模块分析,发现只有GRIK3富集到子网络当中,基因的GO功能富集分析和KEGG通路分析发现GRIK3主要参与和癌症相关的一些生物学过程以及通路。随后免疫组化结果提示,相比胃癌的邻近正常组织,GRIK3在胃癌中显著高表达。结合病人的临床病理资料分析发现,GRIK3的高表达与胃癌的TNM分期、淋巴结转移以及预后差显著相关。为了进一步研究GRIK3的表达与淋巴结转移之间的关系,做了一个补充实验,结果显示在淋巴结转移灶中GRIK3的表达比胃癌原发灶更强。单因素和多因素分析结果显示,GRIK3的表达是胃癌的一个独立的预后影响因素。总而言之,本研究揭示了GRIK3的表达可以作为胃癌一个独立潜在的预后生物标志物以及胃癌患者的潜在的治疗靶点。  结论:本研究第一次发现GRIK3是胃癌的一个新致癌蛋白,并且和TNM分期以及淋巴结转移显著相关。高表达的GRIK3主要是通过淋巴结转移影响胃癌患者的预后。而且GIRK3的表达可以作为胃癌患者的一个独立的预后影响因素,并且可以作为胃癌伴淋巴结转移的一个生物标志物。
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