在当前经济迅速发展的时期，尤其是党的十八大以来，事业单位的内部控制建设与“习李新政”积极推动的廉政风险防控机制建设在思路、方向、内容、方法上高度一致，成为落实廉政风险防控的必然需求和重要举措。目前事业单位在现有管理体制的运作下，仍存在很多问题，例如内部控制意识不强，管理制度不够完善，财政资金无法有效利用，不重视风险的防范，设立“小金库”，贪污腐败现象时有发生，这些问题的产生无不与事业单位内部控制不完善相关。然而，从实际情况来看，很多事业单位在管理方面都或多或少地存在着一些问题，特别是在内部控制职能的有效发挥方面，所以急需构建完善的内部控制体系。　　本文采用了规范研究和案例研究相结合的方法。首先回顾了国内外对内部控制相关理论的研究和文献；梳理了内部控制的发展历程及现状；其次本文对事业单位内部控制体系的现状及问题进行分析；然后本文从内部控制五大要素即内部环境、风险评估、控制活动、信息沟通、内外部监督出发对 X科研所的内部控制现状进行分析，并指出其中存在的隐患，为内控体系的构建提供支持；接着本文对X科研所的内部控制体系实施效果进行评价，从中发现本单位内部控制体系存在的缺陷和不足，并根据分析的缺陷和不足，来改进其内部控制体系，使其更加完善；最后本文对X科研所进行内部控制体系的重新构建，包括单位层面和业务层面内控体系的建立，以及建立相应的风险评估机制和监督管理机制。通过研究，本文得出以下结论：首先，事业单位应从单位层面到具体的业务层面分别设计符合自身特点的内部控制体系。因地制宜的方案设计可以对内控实际工作开展有更好的指导作用，并且跟进方案可以取得有效成果。其次，事业单位的内控创建是一个长期性的工作，需要根据具体的内、外部环境的变化进行跟进和调整。