基于深度学习的细胞时序图像分类

来源 :东南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhhaibin
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
在医学研究中,通常需要根据细胞或类器官的形态及存活率来达到一些研究目的。在细胞研究中有一类常见的问题,即细胞的时序图像分类问题。常常需要通过细胞随着时间变化的图像,提取一些时间信息和空间信息,以对细胞的时序图像分类。基于细胞图像的数据形式的不同,本文将细胞的时序图像分类问题分为了以下三类:1.每一张图片中包含多个细胞的细胞时序图像;2.每一张图片中包含一个细胞主体的细胞时序图像;3.以视频形式拍摄细胞在一段时间内变化的细胞时序图像。本文结合深度学习的方法,分别为以上三种细胞时序图像分类问题提出了解决方案并加以算法改进。并给出了针对以上三种问题的三种不同场景任务:通过培养脐带间充质干细胞多代并拍摄细胞图像,对脐带间充质干细胞时序图像分类。对药物作用的癌细胞的时序图像进行分析,判断药物种类。根据药物作用前后的心肌球视频判断药物种类。主要研究内容如下:1.本文对脐带间充质干细胞识别进行研究。实验人员对若干株脐带间充质干细胞培养若干代且每一代拍摄若干张的细胞图片,通过细胞的形态以及每一代之间的差异来识别脐带间充质干细胞。本文在Res Net-LSTM网络上做了改进,基于多尺度和注意力机制提出了MSA-Res Net-LSTM网络,在测试集上取得了94.8%的准确率,对大多数细胞株图片能正确识别。2.本文对药物作用下的癌细胞时序图像分类进行了研究。本文使用了药物作用下细胞的时序图像,基于深度学习的方法,以3D卷积神经网络中的I3D网络作为基础,并且提出了能单独提取时间特征和空间特征的漏斗卷积结构替换3D卷积核,改进了网络。在测试集上取得了91.4%的准确率,能较好地药物筛选。3.对于药物作用的心肌球类器官,实验人员希望通过心肌球收缩的视频而知道药物的种类。本文使用了图像分割和帧差法来对心肌球收缩视频进行分析,并提出了分段多尺度熵算法,和MSEAMP指标对曲线分类。该指标能较好地对西沙必利,硝苯地平,异丙肾上腺素做出分类。
其他文献
Kubernetes是最受欢迎的容器编排系统,已经成为分布式资源调度和自动化运维的事实标准。为了适应成千上万的应用的工作模式,Kubernetes Operators被官方推荐作为在Kubernetes中打包、部署和管理应用的方法。本文工作针对Kubernetes Operator开发中存在的模版代码冗余、非功能性代码繁多、非Go语言使用者开发困难等问题,提出了一种声明式的通用Kubernetes
水润滑轴承电主轴具有回转精度高、寿命长、热稳定性好等突出的优势,是高速电主轴领域的研究热点之一。然而水润滑静压轴承电主轴依赖于昂贵的高压供水设备,严重制约了该类电主轴在机床领域的工程应用。鉴于此,本文提出了一种采用水润滑动压螺旋槽轴承支承的新型电主轴;然而,本电主轴热源较多,热量产生、传递与耗散机制复杂,加之在高速工况下水润滑动压螺旋槽轴承发热效应明显,对电主轴热特性的影响不容忽视。因此对本电主轴
学位
学位
学位
乳腺癌是近年来威胁女性生命健康的恶性肿瘤之一,目前临床上对乳腺癌常采取的治疗方法主要有手术切除、化疗和放疗等。然而,这些传统疗法对患者身心创伤性极大、用药副作用强、肿瘤复发率高、患者耐受力低且极易破坏自身免疫系统平衡,因此寻求一类安全有效的肿瘤“绿色疗法”是未来临床乳腺癌治疗的重中之重。当前,基于磁性纳米材料的磁感应热效应是一种新型的乳腺瘤治疗手段,可选择性地加热肿瘤组织,致使肿瘤细胞凋亡,而不损
肿瘤热疗是一种将肿瘤组织加热到一定温度使其变性坏死的治疗手段,目前已被广泛地应用于临床肿瘤治疗。随着射频技术的不断发展,射频消融(Radiofrequency Ablation,RFA)已成为常见的肿瘤热疗方法之一,通过在肿瘤区域释放射频交变电流,实现利用射频电流热效应在该区域形成高温热凝固区从而杀灭肿瘤细胞的目的。而有效的肿瘤热疗必须将被治疗组织处的温度控制在适宜的范围内,以保证在有效杀灭局部肿
随着社会信息化程度的高速增长,实际应用如多目标检测、身份识别系统等对高分辨率图像传输接口的需求也随之扩大。同时随着免认证、免授权金、使用数据包机制的Display Port接口协议发展,该接口逐渐表现出对于最为普及的HDMI接口的优势,市场占有率也逐渐提高。所以本文为了解决国产FPGA芯片在支持HBR2级别Display Port输出接口方面的空缺,使用和国产FPGA芯片具有相同功能和相似性能的硬
随着电子通信技术在越来越多的领域得到发展应用,环境中电磁干扰信号的种类和数量均在不断增加,导致电子设备进行辐射发射现场测量时环境电平难以达到标准要求。阵列信号处理与自适应噪声抵消相结合进行环境信号抑制的方法是解决环境电平问题的一种有效方法。接收天线阵列作为该方法接收系统中的重要一环是影响辐射发射测量准确性的关键因素,因此对接收阵列误差校正方法的研究十分必要。此外,为了进一步实现使用少阵元阵列完成复
学位