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近年来,由于人类活动引起水环境变化、外来物种入侵、过度捕捞等对鱼类资源造成严重影响,鱼类多样性呈下降趋势。传统的鱼类多样性调查方法往往费时费力且目标捕获率较低、无法满足对鱼类无伤损的动物福利要求。eDNA宏条形码技术（eDNA metabarcoding）在鱼类监测中显示出省时省力、灵敏度高且可标准化的优点,具有极大的应用前景。本研究分别使用传统捕捞方法和eDNA宏条形码技术对大冶湖鱼类进行多样性调查并对比分析,探索eDNA宏条形码技术对湖泊鱼类监测的可靠性和有效性,为此新技术的发展完善、应用研究做铺垫。其主要研究结果如下:1.基于传统捕捞方法对大冶湖的鱼类资源进行调查,共捕获到鱼类4目6科18属24种。其中鲤形目17种、鲈形目4种、鲇形目2种、鲱形目1种,种类分别占比70.8%、16.7%、8.3%、4.2%。通过相对重要性指数IPI值分析,鲢（Hypophthalmichthys molitrix）、鳙（Hypophthalmichthys nobilis）为大冶湖的优势种,短颌鲚（Coilia brachygnathus）、团头鲂（Megalobrama amblycephala）、鲫（Carassius auratus）、达氏鲌（Culter dabryi）和（?）（Hemiculter leucisculus）为大冶湖的重要种。通过对大冶湖鱼类多样性分析,鱼类的Shannon-Wiener多样性指数（H）范围为0.714～2.237,Simpson优势度集中指数（C）范围为0.457～0.879,两种指数均表明大冶湖牛皮港水域的鱼类多样性最高,白沙塆水域的鱼类多样性最低。2.通过eDNA宏条形码技术,选取扩增eDNA的线粒体细胞色素C氧化酶亚基I（Cytochrome Oxidase I,COI）和12S r RNA两个基因区域,对大冶湖鱼类多样性进行研究。eDNA-COI样品的高通量测序采取先直接拼接再质控的方式,去除嵌合体用于后序分析的有效序列对数在49252～69776之间。eDNA-12S样品采取先质控再拼接的方式,去除嵌合体用于后序分析的有效序列对数在69264～74224之间。对有效序列进行聚类分析,COI共得到3113个OTU,12S共得到3683个OTU。3.eDNA-COI样品Alpha多样性分析可得:Shannon指数范围为3.168～5.003;Simpon指数变化范围为0.019～0.158;ACE指数变化范围为577.031～1563.512;Chao指数变化范围为579.222～1553.881。四种指数均表明大湾水域群落物种的丰富度和多样性最高,三家塆水域物种丰富度最低,高架桥和刘家湖水域物种多样性较低。eDNA-12S样品Alpha多样性指数分析可得:Shonnon指数3.610～4.978;Simpon指数变化范围0.023～0.107;ACE指数变化范围424.076～1428.967;Chao指数变化范围422.000～1392.707。通过指数可得林家湖水域物种丰富度最高,大泉湾水域物种丰富度最低。刘家湖水域物种多样性最高,高驾桥水域物种多样性最低。4.eDNA-COI样品Beta多样性分析得:PCA分析、PCo A分析和NMDS分析均表明大湾和牛皮港水域差异较小;PCA分析和PCo A分析表明高架桥水域与白沙湾水域的群落物种组成差异较大,NMDS分析三家塆与林家湖水域差异比较大。eDNA-12S样品Beta多样性分析得:PCA分析表明高架桥与白沙湾水域的群落物种组成差异较大,刘家湖与白沙湾水域的群落物种组成差异较小。PCo A分析表明高架桥与刘家湖水域的物种组成差异较大,牛皮港与高架桥水域的物种组成差异较小。NMDS分析得,刘家湖和白沙湾差异较小,牛皮港与白沙湾差异比较大。5.经物种注释,eDNA-COI注释到鱼类2纲（辐鳍鱼纲和软骨鱼纲）13目17科20属20种。其中淡水湖泊鱼类7种,占比35.0%,分别为鲢（Hypophthalmichthys molitrix）、鲫（Carassius auratus）、草鱼（Ctenopharyngodon idellus）、鲤（Cyprinus carpio）、鲇（Silurus astotus）、花（?）（Hemibarbus maculatus）和平口鮈（Ladislavia taczanowskii）。eDNA-12S注释到鱼类2纲（辐鳍鱼纲和软骨鱼纲）17目26科29属29种。其中淡水湖泊鱼类3种,占比10.3%,分别为鳙（Hypophthalmichthys nobilis）、黄黝鱼（Hypseleotris swinhonis）、马口鱼（Opsariichthys bidens）。通过eDNA宏条形码技术监测出的淡水湖泊鱼类10种,隶属于3目3科10属。与传统方法共同监测到的鱼类有5种,分别为鲢（Hypophthalmichthys molitrix）、鳙（Hypophthalmichthys nobilis）、鲫（Carassius auratus）、草鱼（Ctenopharyngodon idellus）、花（?）（Hemibarbus maculatus）。