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丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus, HCV)是慢性肝病的主要病原体,单股正链RNA病毒,其感染呈世界性分布,目前全球约有1.7亿感染者,而且每年仍有约300万-400万新发病例；我国HCV感染率约为3.2%,即约有3800万HCV感染者,80%以上的感染者形成与慢性肝炎、肝硬化、肝衰竭及肝细胞癌相关的持续性感染,感染20年后有10%-20%慢性患者发展至肝硬化,感染30年后有1%-5%慢性患者发展为肝癌。目前对慢性HCV感染的治疗主要是长效干扰素结合利巴韦林进行抗病毒治疗,但有效率仅在50%左右,因此能否研制出安全有效的预防性及治疗性的疫苗成为了当今解决HCV慢性感染的重要问题。但HCV在机体内常以部分变异但又高度同源的准种形式存在,并表现出不同部位具有不同的变异程度,编码包膜蛋白的E2/NS1区可变性最高,且有研究显示该区的变异可能与HCV感染的慢性化及疾病进程有关。HCV和人类免疫缺陷病毒(Human immunodeficiency virus, HIV)因传播途径相同,即血液传播、性接触传播、母婴传播,常合并感染,不同的传播途径合并感染率不同,以血液传播的合并感染率最高,因此有偿献血人群中常合并感染。目的研究HIV对1b型HCV E2/NS1包膜区基因变异的影响,探讨两组间该区基因序列同源性的差异,为HCV/HIV合并感染者中HCV的治疗奠定基础。方法对某有偿献血村随访到的所有HCV阳性的病例根据合并HIV的情况分成两组,并进行基因分型,然后RT-巢式-PCR扩增1b型HCV E2/NS1包膜区基因,进行SSCP、纯化后测序。结果HCV基因型在HCV/HIV合并感染组及单纯HCV感染组两组间的的分布差异具有统计学意义(χ2=35.4,P<0.001),且单纯HCV感染组中HCV的基因型较复杂；SSCP的平均条带数在两组间的差异具有统计学意义,单纯HCV感染组较多；两组内的变异均主要来自于HVR-1、HVR-2、HVR-3,而两组间HCVE2/NS1包膜区、HVR-1、HVR-3同源性差异具有统计学意义；单纯HCV组中变异性较高的氨基酸位点在HCV/HIV合并感染组中均表现出较高的保守性。结论1、两组均以HCV1b基因型为主,但全部HCV基因型在两组间分布的差别具有统计学意义。2、HIV/HCV感染降低了1b型HCV E2/NS1包膜区基因的变异性,主要体现在HVR-1和HVR-3区。