当今社会,经济形势日新月异,加上疫情的冲击,创新对企业的长远发展越来越重要。医药制造业在我国有着举足轻重的地位,其创新水平不仅关乎我国经济的发展,更关乎我国国民的健康。但医药制造业创新存在周期长,投资高等高风险特点,管理者基于自身利益,容易回避风险,减少将资源投入风险高的创新活动,近些年来我国医药制造业企业的创新活动不容乐观。在经济环境动荡下,寻找与企业政策、财务状况等契合的股权激励机制可以有效地缓解企业高管与所有者之间的委托代理问题,加大企业在创新活动中的投入与产出。因此,本文从企业所处的环境不确定性的角度出发,研究了股权激励对医药制造业企业创新活动的影响。本文从理论分析以及实证检验两个部分进行了系统地研究。首先,本文使用文献研究法梳理了国内外与研究相关的文献,总结了文章涉及到的相关经典理论如委托代理理论、信息不对称理论和激励理论等。然后,本文收集相关资料,概括了我国医药制造业现阶段的创新现状以及股权激励机制的实施现状。基于以上总结的理论体系与分析出的作用机制下,本文顺着逻辑提出了相关假设。为了验证假设的正确性,本文选取了我国医药制造业上市公司2006年-2020年的相关数据为面板数据,运用STATA软件,分别使用固定效应模型探讨医药制造业企业股权激励对创新活动的关系,并且探讨环境不确定在其中的调节作用。为增强模型的科学严谨性,本文进行了稳健性检验,并且进行了不同股权性质的企业异质性分析,进行了更深入的研究。最后,根据文章理论分析的结论以及实证运行的结果验证了前文提出假设的真伪,得到本文的研究结论,结合我国企业股权激励现状提出了相关政策建议,并在文章的最后提出了本次研究存在的不足之处和对未来研究的展望。基于理论分析与实证检验,本文得出以下结论:（1）总的来说,股权激励机制的实施会促进医药制造业创新水平的提升。（2）环境不确定性在医药制造业股权激励与创新活动的正相关关系中起到负向调节的作用。（3）相对于国有企业,股权激励在非国有企业更能发挥促进创新的效用。基于我国医药制造业股权激励及创新现状本文提出建议:（1）医药制造企业可通过制定适合本公司的股权激励机制的方式来达到促进企业创新的目的。（2）为了发挥股权激励的效果,需要稳定企业所处的环境。（3）应丰富国有企业激励方式,增加精神激励,如晋升激励等。