由 Y 染色体短串联重复序列（Y-chromosomal short tandem repeats,Y-STRs）和Y-DNA单倍群所构成的Y染色体单倍型,可以用来描述未知男性的父系特征。但是,Y染色体遗传标记目前尚不足以进行精确的个体识别。近年来,随着大规模并行测序（massiveparallel sequencing,MPS）技术的发展,法医遗传学中引入了微单倍型（microhaplotype）的概念,微单倍型作为一种新型遗传标记,有望促进法医个体识别鉴定和DNA混合物的解析。因此,在不同的法医学应用场景中,特别是有男性嫌疑人的犯罪现场（如性侵犯案件）,联合使用两者,可为案件提供更多的侦查线索。在本研究中,首次联合微单倍型和Y染色体遗传标记,基于多重PCR和150 bp 双端 MPS 技术,研发了 MY 系统（Microhaplotype and Y-SNP/STR）,包含 114个 Y-SNPs（涵盖 12 种主要的 Y-DNA 单倍群）,45 个 Y-STRs（N-1 Stutter＜0.09;突变率＜5 × 10-3）和22个微单倍型遗传标记（等位基因测序深度比＞0.91;两两遗传距离＞10Mb）。在100名广东汉族中,MY系统22个微单倍型遗传标记的有效等位基因数量（effective number of alleles,Ae）的平均值为7.17（3.62-14.72）,其累积个体识别能力为1-5.00 × 10-31,累积二联体和三联体非父排除概率分别为 1-5.00 × 10-8 和 1-4.85 × 10-12。在千人基因组计划（1000 Genomes Project,1KG）群体中,经过全面法医学评估和法医群体遗传学分析,MY系统22个微单倍型遗传标记的系统效能,大致相当于26-28个法医常用STRs的系统效能,MY系统可作为STR的有效补充用于法医学实践（个体识别,亲子鉴定,DNA混合物解析和生物地理祖源推断等）。基于MY系统,针对两人DNA混合物的解析,我们提出了基因型模式识别（genotype pattern recognition,GPR）。根据等位基因测序深度（depth of coverage,DoC）的降序排列特征,将两人DNA混合物的26种不同的基因型组合整合为9种基因型模式,在此基础上,使用10组男性-男性DNA模拟混合物,验证了 GPR的实际应用范围（混合比例:1:10-1:2）。通过回归分析,针对不同的遗传标记和基因型模式,建立了真实混合比例（actualmixingratio,AMR）与DoC 比（RDOC）之间的回归关系。如果观测RDoC值位于RDoC交集内的5个重叠区域（overlapping areas）,主要贡献者和次要贡献者的基因型需要似然比的方法判断;如果观测RDoC值位于其他非重叠区域（RDoC交集外的绝大部分区域和RDoC交集内的非重叠区域）,在期望真实混合比例E（AMR）的辅助下,通过观测RDoC值与RDoC范围直接比较,观测RDoC值的基因型模式可以被识别。因此,基于MY系统,可以通过GPR策略来实现两人DNA混合物的解析（实际应用范围为1:10-1:2）。