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牙鲆是重要海水经济鱼类。随着养殖技术的发展，牙鲆已经成为我国主要的海水养殖对象。伴随牙鲆近亲繁殖问题进行牙鲆遗传改良研究，培育出具有生长快、体型大和抗逆性强等优良性状的新品种，将对我国牙鲆养殖业的可持续发展具有重要意义。本文研究主要基于微卫星标记与着丝粒之间的相对距离，筛选位于连锁群不同位置的微卫星标记进行牙鲆有丝分裂雌核发育二倍体的遗传鉴定和不同二倍体的比较研究。1.本研究从日本第二代连锁图谱选择均匀分布于牙鲆24个连锁群的72个微卫星标记，用两个正常的全同胞家系来验证得到，72个微卫星位点均符合孟德尔遗传分离测验。紫外线照射牙鲆精子并通过冷休克诱导而获得4个减数分裂雌核发育家系，估计标记-着丝粒（Microsatellite-Centromere，M-C）之间的相对距离，。在假设无交叉干涉的情况下，17个标记位于着丝粒区域，19个标记位于连锁群中部，36个标记位于远着丝粒区域。用36个标记来鉴定有丝分裂雌核发育二倍体192尾。2.以牙鲆选育基础群体为亲本，选择性腺发育良好的个体制备普通二倍体（ND），减数分裂雌核发育二倍体（MGD-1）、连续两代减数分裂雌核发育二倍体（MGD-2），并利用MGD-1发育达性成熟的雌鱼与同时诱导的性反转伪雄鱼交配制备近交二倍体（MGD-3）。从牙鲆遗传连锁图谱选择均匀分布于24个连锁群的72个微卫星标记，在假设无交叉干涉的情况下，17个标记位于着丝粒区域，19个标记位于连锁群中部，36个标记位于端粒区域。分别选择上述区域的微卫星标记鉴定牙鲆4种二倍体的遗传特征。分析结果显示，4种二倍体的等位基因数（A）和多态信息含量（PIC）在不同区域变化范围较小，ND的A和PIC均为最高，MGD-3则表现为最低。随着标记与着丝粒之间距离的增加，4种二倍体的观测杂合度逐渐升高，纯合度逐渐降低。纯合个体比例在着丝粒区域最高，为8.8%-29.1%；在端粒区域最低，为2.4%-23.2%。其中，MGD-1和MGD-2的变化幅度显著高于其余二倍体。由此证明，选择连锁群上不同位置的微卫星标记对鉴定牙鲆不同二倍体的遗传特征具有显著影响。