逆转座子广泛分布于植物界,是转座元件中数量最多的一类。Tyl-copia类逆转座子是植物中研究较为深入的一类,其以RNA为中介,采用“复制-粘贴”的方式进行转座,对植物基因组大小、结构、进化等都有重要影响。逆转座子在植物基因组中拷贝数多,异质性高,并且在种内和种间表现出较高的序列差异性和丰富的插入多样性,基于这些特点开发的逆转座子分子标记成为遗传多样性研究和遗传连锁图谱及性状定位的重要工具。黄瓜是我国主要蔬菜作物之一,也是世界性重要蔬菜。多年的人工选育和及栽培的杂优化,使黄瓜自然资源的多样性受到侵蚀,栽培品种的遗传背景变得更为狭窄。因此开展甜瓜属逆转座子分子标记的开发及其应用研究,将对甜瓜属作物的遗传多样性分析和抗病基因的发掘具有重要意义,并且为甜瓜属的分子育种开拓了新的道路。1.甜瓜属IRAP分子标记技术的建立根据甜瓜属Tyl-copia类逆转座子的长末端重复序列信息,通过逆转座子引物设计及扩增体系优化,建立起了适合于甜瓜属的IRAP (inter-retrotransposon amplified polymorphism)标记系统。进一步将该标记用于甜瓜属不同类型材料间的聚类分析,发现该标记能有效地检测不同类型间的多态性,可成为构建指纹图谱新的标记系统。2.甜瓜属REMAP分子标记的开发与应用基于甜瓜属Tyl-copia类逆转座子的长末端重复序列信息,结合ISSR引物序列,在体系优化的基础上建立了适用于甜瓜属物种的REMAP (Retrotransposon-microsatellite Amplified Polymorphism)标记系统。通过对46份甜瓜属不同类型材料进行聚类分析,证明该标记系统能有效检测甜瓜属不同类型材料间的多态性,可以用于甜瓜属作物品种鉴定及指纹图谱构建。3.基于逆转座子分子标记和种间渐渗的甜瓜属野生抗霜霉病相关基因的发掘利用逆转座子分子标记cDNA-SSAP从酸黄瓜和抗霜霉病渐渗系ILDM10-4中得到霜霉病菌接种后差异表达基因片段58条。经过序列比对后,分析得到3条分别与抗逆相关基因酪氨酸蛋白激酶,过氧化氢酶,赖氨酸特异性去甲基酶同源的差异表达片段。RT-PCR技术检测所分离基因片段的表达,表明3个基因片段在整个侵染过程都有很强的表达,也显示出与抗霜霉病机制相关。