当今世界正面临百年未有之大变局,产业结构升级优化的压力促使各国在新时代下对国家战略进行改变,发展是解决当前问题的唯一途径。目前我国处在经济新常态的压力下,经济结构转型迫在眉睫,各类原因诸如国际产业竞争日趋激烈、我国核心产业发展态势略显疲软、自然资源开采过度、环境承载力降低约束地区经济发展、人口要素以及资源要素成本上升等矛盾日益突出。科技园区作为世界各国和地方政府推动高新技术产业发展、承载区域创新、经济发展建设以及主要社会功能的重要载体,是我国赶超全球高新技术产业发展的重要助推器、抢抓跨越式历史性发展机遇、推动经济社会发展和创新型国家建设的重要支撑点。而随着创新在经济活动以及社会发展过程中起到的作用越来越大,创新要素也逐渐成为驱动全世界国家地区经济发展的关键,发展科技园区建设并对所在区域创新要素进行优化配置研究,能帮助我们从更深层次利用创新要素,为全面诊断区域创新发展中出现的问题提供依据。本文在针对武汉东湖高新技术开发区开展研究基础上,对当前科技园区建设中所需关注的重点以及区域创新要素的相关理论进行了系统梳理,利用层次分析法分析研究了其在区域创新要素配置的应用场景,并提出应对武汉市区域建设过程中存在的不确定性因素的解决方案。通过对当前武汉东湖高新技术开发区现状进行案例分析,了解到科技园区对创新要素优化配置起到的作用,并从东湖高新技术开发区的基础环境、产业结构、文化氛围、辅助机制以及开放式发展等方面提出对园区创新要素的对策建议,结合近两年来园区内创新要素优化配置后对园区产生的作用,并根据城市未来发展提出相关建议,进一步指明东湖高新技术开发区在武汉市产业结构升级调整中的重要地位,最后对武汉市未来的发展做出展望。