瓦氏雅罗鱼耐碱候选基因的多态性及表达差异研究

来源 :上海海洋大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:gchy111
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我国在世界上是一个水产养殖大国,其中淡水鱼类养殖在水产品养殖中占据了很大份额。然而近年来,受降水量减少气象条件的影响,河流、湖泊水位下降、矿化度上升,导致可供水产养殖所使用的淡水资源减少;同时受18亿亩耕地红线的限制,池塘养殖过多占用耕地成为历史;这些都成为制约淡水鱼类养殖业发展的瓶颈。因此培育耐碱鱼类新品种,利用内陆丰富的盐碱水(土)资源发展水产养殖业具有广阔的前景。而阐明鱼类耐碱的分子机理是开展此项工作的理论基础。瓦氏雅罗鱼(Leuciscus waleckii)隶属鲤形目、鲤科、雅罗鱼亚科,具有极强的耐高盐碱特性,能够耐受我国内蒙古达里湖碱度53.57 m M(p H 9.6)的恶劣条件,是开展鱼类盐碱适应性进化及耐盐碱分子生理机制研究理想的实验材料。本研究以来自达里湖(盐碱水)和松花江(淡水)的瓦氏雅罗鱼杂交F2为实验材料,通过碱度耐受实验测定其耐受能力;以38对多态的EST-SSR和SSR为标记,对77个F2个体进行基因分型,根据Fisher确切概率法对F2基因型和耐碱性状进行关联分析。结果发现,有2个标记与耐碱性状显著相关(p<0.05),其中1个标记为EST-SSR。从瓦氏雅罗鱼转录组数据库中调取该EST序列,基因注释结果显示该序列与团头鲂低氧诱导因子HIF-3?基因、草鱼的低氧诱导因子HIF-4?基因具有很高的同源性。该基因的主要功能是参与鱼类的耐低氧反应过程,提高鱼类的耐低氧能力。结合课题组对瓦氏雅罗鱼进行数字差异表达谱分析得到的结果,将HIF-3?基因与Rhag,Rhbg,Rhcga和Rhcg2a基因一起作为雅罗鱼耐碱候选基因进行后续研究。为从基因表达水平上研究雅罗鱼耐碱机制,选取内蒙古达里湖碱水雅罗鱼和松花江淡水雅罗鱼作为实验材料,采用相对实时荧光定量PCR技术对候选基因进行表达量差异检测。结果显示5个候选基因在两种不同的雅罗鱼群体中表达方式及表达量均存在很大差异,证明筛选到的5个候选基因与雅罗鱼耐碱性状有着紧密的关系,并获得候选基因全长c DNA序列。雅罗鱼鳃组织碱度差异表达的候选基因的获得为进一步研究目的基因的功能提供了参考依据,对于今后深入研究鱼类的耐碱机制提供更加可靠的数据支持,对不耐碱鱼种的分子设计育种也有着重要意义。
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