复合期权方法在项目价值评估中的作用越来越重要，目前它已逐渐成为学术界研究的热点问题。与传统的净现值评估方法不同之处在于：复合期权方法采用了金融期权的观点，考虑了投资管理的柔性并能够很好地处理项目研发中的不确定性，因而复合期权理论与方法在项目的投资决策中，特别是在多阶段投资决策分析中具有得天独厚的优势。本文研究的是多阶段复合期权定价问题。复合期权是一个连续的阶段性的过程，该过程由多个阶段组成，且每一阶段实际上是在执行下一个阶段的期权。我们首先对二阶段复合期权定价模型给出了一个新的证明，主要采用由一维标准正态分布函数推导出二维标准正态分布函数的思想方法。其次，传统的多阶段复合期权模型假定波动率是常数，这个假定并不符合实际情况。针对这个缺陷我们引入了变波动率，建立了三阶段变波动率复合期权定价模型，得到了其封闭解。改进的复合期权模型还考虑了如何处理各阶段所出现的风险对期权价值的影响，而传统的复合期权模型忽略了这一问题。本文以在医药项目评估中出现的六阶段复合期权模型为例，在每个阶段都考虑了由各种风险产生的成功概率，并用泊松分布与层次分析法计算概率的大小，推导出了改进的六阶段复合期权定价模型，得出其封闭解。在论文的最后部分，我们用改进的六阶段复合期权模型来评估一个新药研发项目的价值，计算结果表明改进的模型更符合实际情况。此外，由于期权定价的阶段越高越复杂，导致了很多从业者难以使用高阶段的模型，阻碍了多阶段复合期权定价方法的应用发展。本文针对多阶段复合期权定价模型提出了一个简明的计算程序，可以使这种方法应用在更广泛的领域。