肿瘤抑制蛋白APC与Amer1的结合机理研究

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APC (adenomatous polyposis coli,APC)是一个全长2843个氨基酸的多结构域蛋白,是Wnt信号通路的负调节剂,能够和很多蛋白相互结合以发挥作用。其N端含有一个最保守的ARM(Armadillo repeats)结构域。我们试验中用到的407-775片段就包含了此结构域,它能与许多蛋白结合并发挥功能。Amer1蛋白包含1135个氨基酸,根据生物信息学分析结果显示其不含有显著的功能性结构域,据报道Amer1含有三个与APC结合的位点:A1,280-368; A2,380-531; A3,716-834。本论文中,我们首先通过BLAST与Alignment的方法得到了Amer1365-375这一保守片段,其中325-335是其中第一个能与APC结合的保守序列(数据待发表),由于Tanneberger, K.等人在划分Amer1的区间片段时A1截止在了第368个氨基酸上,所以使得365-375这一保守序列被直接的忽略了,而我们有幸找到了这段序列,做了GST-Pulldown与ITC实验验证了他们的结合。并且拿到了APC-ARM与Amer1365-375片段的晶体,解析了两者的空间结构。接下来我们试图得到APC-ARM与A3复合物的晶体时,对A3的片段不能准确的定位,于是再次通过BLAST与Alignment找出Amer1中此片段的保守区域。根据结果我们构建、表达纯化了带GST标签的Amer1片段716-834、766-823、766-777、786-823、766-823△778-794。通过GST-Pulldown与ITC实验证实了以上最短的片段Amer1766-823△778-794能够与APC-ARM结构域结合,而且片段766-777与786-823均不能与此结合。由此可知,Amer1与APC-ARM相结合的四个位点中A3片段的结合方式是独特的,它不仅仅是依靠像A1、A2、A4那样的几个关键氨基酸与APC-ARM相结合,而是采用两端的氨基酸形成一定的高级结构,再通过此结构与APC-ARM结合,缺失的序列778-794在A3与APC-ARM的结合中不起作用。然后通过各种蛋白纯化的方法得到了APC-ARM/Amer1766-823△778-794的复合物,其中包括酶切GST标签后再纯化,TEV及Trypsin依次酶切之后再纯化。但当我们得到蛋白复合物之后筛选晶体时总是拿不到晶体,看来A3片段Amer1766-823△778-794还是不利于晶体的生长,需要我们进一步的准确定位A3。
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