资源配置问题是管理科学中的经典问题,其目的是在给定的各种有限社会和自然资源情况下,按照经济社会生产活动的客观需要,根据一定的社会规则或分配机制,将有限的社会资源分配给不同部门,不同行业,不同地区和不同的生产群体,以获得最大的投入产出效率。对于产业结构而言,产业结构调整的核心就是资源配置,产业结构调整的过程是资源配置的过程。基于此,本文利用数据包络分析(DEA)方法,对于城市圈的资源配置问题进行了探讨。本文主要工作和创新之处在于：(1)综合研究了含有非期望要素的DEA模型从非期望要素本身属性出发,研究了DEA模型对非期望要素的处理方法。依照期望与非期望产出之间能分开调整的假设,分为分离与不分离模式；依照模式处理非期望产出的着眼点,可分为直接法与间接法。同时,就采用间接方法的分离式相对效率衡量、采用直接方法的分离式相对效率衡量、不分离式效率衡量等三类处理非期望要素的方法作了具体深入的研究。在此基础上,考虑只有投入或者只有产出的单边含有非期望要素及投入和产出的双边均含有非期望要素两个方面建立了相应的数学模型,并讨论了模型所代表的经济意义。(2)提出了一种研究DEA内部决策过程的新方法本文研究将一个决策单元分解成若干个子单元,来分析决策单元内部的运行机制。在求出最优产业结构效率下,确定非期望产出在子决策单元的最优分配比例,再把求出的最优分配比例代入单边非期望模型中进行效率分析。通过这个方法建立的新的DEA模型,以解决含有非期望要素和要素共享的情况,得出的模型与基于非期望要素DEA模型相比而言满足分类不变性。(3)建立了含有非期望要素的三阶段模型,并对该三阶段模型进行集成以DEA模型为基础,考虑使期望产出最大、使非期望产出最小、使投入最小这个三个不同的目标,结合分层排序法将多目标问题转化成多个单目标问题,建立相应的规划模型。建立三阶段模型过程中,三个不同目标的排序按照实际经济活动的优先序确定,即按照期望产出最大为首要目标,非期望产出最小为其次目标,投入最小为最次目标这样一个顺序。结合线性加权和法,引入一组权系数,对期望产出取极大,非期望产出、投入取极小,将原多目标问题转化成一个单目标问题,构建集成模型以处理非期望产出存在下的效率评价问题。(4)提出了资源配置中的资源共享或者投入产出约束DEA模型在实际资源配置问题中,较多情况下要么是投入资源共享(如行政部门掌控分配资金总额),要么是产出约束(如碳排放总额),这些都将制约着资源配置过程。本研究中,无论是在一个决策单元分解成若干个子单元研究中,还是在多目标决策集成DEA模型中,均充分考虑了这一条件,将其加入到相应的DEA模型中,作为模型约束条件。(5)实证研究在充分总结了本文研究的相关城市圈的产业结构问题后,利用含有非期望要素和产出约束的DEA模型对武汉城市圈的产业结构合理性及调整方向等方面进行分析；利用含有非期望要素的三阶段单一模型及集成模型对武汉城市圈的资源配置效率进行计算。通过对武汉城市圈的实证研究结果,为相关部门的政策制定和产业结构调整提供了理论上的参考。