CircRNA0003307竞争性结合miR-191-5p调控CDK6/NF-κB介导强直性脊柱炎湿热证患者免疫炎症的机制及黄芩清热除痹胶囊干预研究

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1目的通过高通量测序筛选强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)湿热证患者外周血单核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)差异环状RNA(circular RNA,circRNA)表达谱,观察黄芩清热除痹胶囊(Huangqin Qingre Chubi Capsule,HQC)对AS湿热证患者CircRNA0003307/miR-191-5p/CDK6组合及免疫炎症反应的影响,并从竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ce RNA)角度探讨AS湿热证患者免疫炎症的机制及HQC干预机制。2方法2.1研究一:基于高通量测序的AS湿热证患者PBMCs中CircRNA0003307的变化及临床相关性研究通过高通量测序筛选AS湿热证患者PBMCs中差异表达circRNA,选择免疫炎症关键基因CircRNA0003307,采用生物信息学预测微小RNA(Micro RNA,miRNA)及m RNA,构建CircRNA0003307/miR-191-5p/CDK6组合。观察AS湿热证患者免疫炎症关键基因CircRNA0003307与核因子κB(nuclear factor kappa B,NF-κB)信号通路、细胞因子、疾病活动及患者感受(self-perception of patient,SPP)的关系。2.2研究二:基于数据挖掘的黄芩清热除痹胶囊对AS湿热证患者CircRNA0003307/miR-191-5p/CDK6及免疫炎症的影响通过数据挖掘收集AS湿热证患者实验室指标、疾病活动指标及SPP等临床资料,并探讨HQC干预后AS湿热证患者CircRNA0003307/miR-191-5p/CDK6组合、NF-κB通路、细胞因子、疾病活动及SPP的变化情况。2.3研究三:基于ce RNA网络的CircRNA0003307/miR-191-5p/CDK6组合调控关系及介导AS湿热证患者巨噬细胞炎症反应的功能研究分离AS湿热证患者PBMCs,通过磁珠分选巨噬细胞进行体外培养。观察CircRNA0003307、miR-191-5p及CDK6对巨噬细胞免疫炎症的影响。通过双荧光素酶报告基因检测实验、RNA pull down实验、RNA免疫共沉淀实验(RNAimmunoprecipitation,RIP)及细胞功能回复实验验证CircRNA0003307、miR-191-5p、CDK6之间的靶向调控关系。2.4研究四:基于circRNA过表达探讨黄芩清热除痹胶囊含药血清通过CircRNA0003307/miR-191-5p/CDK6调控NF-κB通路抑制AS湿热证患者巨噬细胞免疫炎症反应通过制备HQC含药血清,使用HQC含药血清处理巨噬细胞。观察HQC含药血清对CircRNA0003307/miR-191-5p/CDK6组合、NF-κB通路、免疫炎症的影响,及CircRNA0003307过表达状态下,观察HQC含药血清对CircRNA0003307/miR-191-5p/CDK6组合、NF-κB通路、免疫炎症的影响。3结果3.1研究一:基于高通量测序的AS湿热证患者PBMCs中CircRNA0003307的变化及临床相关性研究(1)与对照组相比,AS湿热证患者组有131个circRNAs出现显著变化,其中89个circRNAs表达上调,42个circRNAs表达下调(P<0.05);AS湿热证患者组有973个m RNAs出现显著变化,其中644个m RNAs表达上调,329个m RNAs表达下调(P<0.05)。(2)GO分析表明差异基因主要与表皮生长因子激活受体活性的正调控、滋养巨细胞的分化、氧转运等一系列生物学过程相关。通路分析表明差异基因主要涉及TNF、PI3K-AKT、NF-κB信号通路等。(3)与对照组相比,AS湿热证患者肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、白介素(interleukin,IL)-1β、IL-23、IL-17表达明显升高,IL-4、IL-10表达明显降低(P<0.01);与对照组相比,AS湿热证患者IKBα、NF-κB p65 m RNA表达明显升高(P<0.01)。(3)与对照组相比,AS湿热证患者CircRNA0003307表达明显升高(P<0.01),相关性分析发现CircRNA0003307与血沉(erythrocyte sedimentation rate,ESR)、C反应蛋白(C-reactive protein,CRP)、强直性脊柱炎疾病活动指数(bath ankylosing spondylitis diseases active index,BASDAI)、中医证候积分、TNF-α、IL-1β、NF-κB p65成正相关,与生理职能(role limitation due to physical problems,RP)、社会功能(social functioning,SF)成负相关(P<0.01)。(4)关联规则分析发现CircRNA0003307与中医证候积分、CRP、IL-1β、TNF-α、ESR、BASDAI、NF-κB p65、IL-17上升关联度较高,与RP、情感职能(role limitation due to emotional problems,RE)、SF、VT、身体疼痛(body pain,BP)、总体健康(general health,GH)下降关联度较高,提升度均大于1。(5)通过生物信息学构建CircRNA0003307/miR-191-5p/CDK6组合。与对照组相比,AS湿热证患者miR-191-5p表达明显降低,CircRNA0003307、CDK6表达明显升高(P<0.01)。3.2研究二:基于数据挖掘的黄芩清热除痹胶囊对AS湿热证患者CircRNA0003307/miR-191-5p/CDK6及免疫炎症的影响(1)治疗后两组患者CircRNA0003307、CDK6明显降低,miR-191-5p表达明显升高(P<0.05或P<0.01);而相较于对照组治疗后,治疗组治疗后CircRNA0003307表达明显降低,miR-191-5p表达明显升高(P<0.05)。(2)治疗后两组患者IKBα、NF-κB p65 m RNA表达明显降低(P<0.05或P<0.01);而相较于对照组治疗后,治疗组治疗后NF-κB p65 m RNA表达明显降低(P<0.01)。(3)治疗后两组患者TNF-α、IL-1β、IL-17、IL-23、ESR、CRP表达明显降低,IL-4、IL-10表达明显升高(P<0.05或P<0.01);而相较于对照组治疗后,治疗组治疗后IL-23、CRP表达明显降低,IL-10表达明显升高(P<0.05或P<0.01)。(4)治疗后两组疾病活动各指标均明显改善(P<0.05或P<0.01);而相较于对照组治疗后,治疗组治疗后BASDAI评分明显降低(P<0.05)。(5)治疗后两组SPP各指标均明显改善(P<0.05或P<0.01),而相较于对照组治疗后,治疗组能明显改善RE、SF、BP、VT评分(P<0.05或P<0.01)。3.3研究三:基于ce RNA网络的CircRNA0003307/miR-191-5p/CDK6组合调控关系及介导AS湿热证患者巨噬细胞炎症反应的功能研究(1)与对照组相比,AS湿热证患者巨噬细胞中TNF-α、IL-1β表达明显升高,IL-4、IL-10表达明显降低(P<0.01);与对照组相比,AS湿热证患者巨噬细胞中 CD80、CD86 m RNA表达明显升高,CD163、CD206 m RNA表达明显降低(P<0.01);与对照组相比,AS湿热证患者巨噬细胞中CircRNA0003307、CDK6表达明显升高,miR-191-5p表达明显降低(P<0.01)。(2)过表达CircRNA0003307后,IKBα、NF-κB p65 m RNA及p-IKBα、p-NF-κB p65蛋白表达明显升高;敲降CircRNA0003307后,IKBα、NF-κB p65m RNA及p-IKBα、p-NF-κB p65蛋白表达明显降低(P<0.01)。(3)过表达CircRNA0003307后,巨噬细胞CD80、CD86 m RNA表达明显升高,CD206、CD163 m RNA表达明显降低;敲降CircRNA0003307后,巨噬细胞CD80、CD86 m RNA表达明显降低,CD206、CD163 m RNA表达明显升高(P<0.01)。(4)过表达CircRNA0003307后,巨噬细胞TNF-α、IL-1β表达明显升高,IL-4、IL-10表达明显降低;敲降CircRNA0003307后,巨噬细胞TNF-ɑ、IL-1β表达明显降低,IL-4、IL-10表达明显升高(P<0.01)。(5)CircRNA0003307 positive探针能够显著富集CircRNA0003307和miR-191-5p,表明CircRNA0003307能够与miR-191-5p结合;加入miR-191-5p mimics后,CircRNA0003307、CDK6的WT荧光素酶活性降低;AGO2抗体组中关于miR-191-5p、CDK6基因的富集量显著高于Ig G抗体组。(6)过表达CircRNA0003307能够降低miR-191-5p的表达,升高CDK6的表达,敲降CircRNA0003307能够升高miR-191-5p的表达,降低CDK6的表达;pc DNA-CircRNA0003307上调CircRNA0003307表达后用miR-191-5p mimics转染过表达miR-191-5p,CircRNA0003307及CDK6功能回复。(7)过表达miR-191-5p能够降低TNF-ɑm RNA的表达,升高IL-10 m RNA表达;敲降CDK6能够降低TNF-ɑm RNA表达,升高IL-10 m RNA表达;pc DNA-CircRNA0003307上调CircRNA0003307表达后用miR-191-5p mimics转染过表达miR-191-5p,TNF-α、IL-10 m RNA功能回复。(8)过表达miR-191-5p能够降低IKBα、NF-κB p65 m RNA及p-IKBα、p-NF-κB p65蛋白表达;敲降CDK6能够降低IKBα、NF-κB p65 m RNA及p-IKBα、p-NF-κB p65蛋白表达;pc DNA-CircRNA0003307上调CircRNA0003307表达后用miR-191-5p mimics转染过表达miR-191-5p,IKBα、NF-κB p65 m RNA及p-IKBα、p-NF-κB p65蛋白功能回复。3.4研究四:基于circRNA过表达探讨黄芩清热除痹胶囊含药血清通过CircRNA0003307/miR-191-5p/CDK6调控NF-κB抑制AS湿热证患者巨噬细胞免疫炎症反应(1)CCK8结果显示:当抑制率接近50%时,我们选择20%的含药血清为最佳浓度,24h为最佳作用时间。(2)与模型组相比,HQC含药血清组CircRNA0003307、CDK6表达明显降低,miR-191-5p表达明显升高(P<0.01);AS湿热证患者巨噬细胞转染pc DNA-CircRNA0003307后,CircRNA0003307、CDK6表达明显升高,miR-191-5p明显降低(P<0.01);将pc DNA-CircRNA0003307转染的巨噬细胞和HQC含药血清共培养,CircRNA0003307、CDK6明显降低,miR-191-5p明显升高(P<0.01)。(3)与模型组相比,HQC含药血清组IKBα、NF-κB p65 m RNA及p-IKBα、p-NF-κB p65蛋白明显降低(P<0.01);AS巨噬细胞转染pc DNA-CircRNA0003307后,IKBα、NF-κB p65 m RNA及p-IKBα、p-NF-κB p65蛋白表达明显升高(P<0.01);将pc DNA-CircRNA0003307转染的巨噬细胞和HQC含药血清共培养,IKBα、NF-κB p65 m RNA及p-IKBα、p-NF-κB p65蛋白表达明显降低(P<0.01)。(4)与模型组相比,HQC含药血清组CD80、CD86 m RNA表达明显降低,CD163、CD206 m RNA表达明显升高(P<0.01);转染pc DNA-CircRNA0003307,CD80、CD86 m RNA表达明显升高,CD163、CD206 m RNA表达明显降低(P<0.01);将pc DNA-CircRNA0003307转染的巨噬细胞和HQC含药血清共培养,CD80、CD86 m RNA表达明显降低,CD163、CD206 m RNA表达明显升高(P<0.01)。(5)与模型组相比,HQC含药血清组TNF-α、IL-1β明显降低,IL-4、IL-10明显升高(P<0.01);转染pc DNA-CircRNA0003307后,TNF-α、IL-1β表达明显升高,IL-4、IL-10表达明显降低(P<0.01);将pc DNA-CircRNA0003307转染的巨噬细胞和HQC含药血清共培养,TNF-α、IL-1β表达明显降低,IL-4、IL-10表达明显升高(P<0.01)。4结论(1)AS湿热证患者PBMCs中circRNA差异表达,CircRNA0003307与AS湿热证患者NF-κB通路活化、免疫炎症反应、疾病活动相关。(2)HQC能够降低AS湿热证患者PBMCs中CircRNA0003307、CDK6的表达,升高miR-191-5p表达,抑制NF-κB通路活化,改善免疫炎症反应。(3)AS湿热证患者巨噬细胞中CircRNA0003307能竞争性结合miR-191-5p,调控CDK6/NF-κB,介导免疫炎症反应。(4)HQC含药血清通过调控AS湿热证患者巨噬细胞中CircRNA0003307/miR-191-5p/CDK6组合,抑制NF-κB通路活化,改善免疫炎症反应。
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