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椒样薄荷是新疆的一种香料植物，随着种植年限的增加，椒样薄荷精油品质和产量逐渐下降。本实验对椒样薄荷病毒进行了分子鉴定，并建立相应的检测方法，为椒样薄荷无毒化栽培及生产提供理论基础。 从田间采集表现明显病毒症状的椒样薄荷病株，采用纤维素（CF-11）层析方法，对椒样薄荷植株中的病毒dsRNA进行分离，利用改进的单引物法扩增到一段约400bp产物，然后对其进行克隆与测序。得到该片段核苷酸序列为352bp，序列分析表明为黄瓜花叶病毒（CMV）1a基因的部分序列，与其它已报道CMV1a基因序列同源性高达96％。 根据所获病毒信息，设计了3对针对CMV2a基因、2b基因和CP基因特异性引物，对病株进行了相应目标基因的RT-PCR，结果均扩增到预期的目标片段。利用间接ELISA从186个样品中检测出3个样品呈阳性。并利用免疫反转录PCR（IC-RT-PCR）从分离物MP1中检测到CMV，通过体系优化，建立了针对CMV的IC-RT-PCR检测体系，该体系病毒粗提液的稀释限点为10-6。 根据CMVRNA3基因组全长设计特异引物从分离物MP1中扩增到目标片段，将其进行克隆和测序，得到2189个核苷酸，序列分析表明，该序列与其它已报道CMVRNA3组分核苷酸序列同源性达到90%以上；包含2个分别编码3a基因和CP基因的开放阅读框。3a基因为838个核苷酸，编码一个由279个氨基酸组成的蛋白质（分子量为30.6kDa），与其它已报道CMV的RNA核苷酸同源性为93.4%～96.9%，氨基酸同源性为95.4%～99.1%。CP基因为657个核苷酸，编码一个由218个氨基酸组成的蛋白质（分子量为24kDa），与其它已报道CMV的RNA核苷酸同源性为93.9%～96.8%，氨基酸同源性为97.7%～99.1%。基于CMV基因组RNA3上的3a基因和CP基因构建系统关系树，来自伊犁椒样薄荷的CMV与来自福建的PE分离物关系最近，位于同一个进化分支。