随着科技不断发展，创新的重要性日益突显。为了提高我国的创新绩效，提升创新发展水平，十八大正式提出了创新驱动发展战略。合作创新作为一种重要的创新方式，对于提升创新绩效、促进创新发展具有重要作用。
　　本文依据合作创新理论与创新绩效理论，运用倾向得分匹配法、Tobit回归和Logit回归计量分析方法，对如何提升合作创新绩效，促进创新发展的问题进行了较为系统的研究。首先，归纳梳理了合作创新理论，并且对合作创新绩效评价理论进行深入分析，基于此，本文以合作申请专利表征合作创新，以合作申请专利质量表征合作创新绩效。而且，针对与合作创新绩效影响因素相关的文献进行整理与综述，提出目前研究的欠缺之处。其次，结合理论分析与研究综述，提出本文研究假设和研究变量，进而进行理论模型搭建。再次，基于专利对合作创新绩效影响因素进行实证研究，通过合作申请专利对合作创新进行表征，以专利前向引用次数和转让情况这两个表征专利质量的指标对合作创新绩效进行衡量。分析合作创新对创新绩效的影响，挖掘合作模式、合作领域及合作学科契入点对合作创新绩效的影响。并且比较中美异同，吸收借鉴美国的先进之处。最后，将美国、英国、日本和法国四个国家的合作创新政策进行系统梳理，将合作创新归纳为“政府主导型”、“企业主导型”和“高校主导型”三种类型，为我国合作创新绩效提升与合作创新发展提供借鉴。结合实证分析和政策分析的结果，对我国合作创新绩效提升提出合理化建议。
　　研究发现，合作创新可以提升创新绩效。校企合作创新对提升合作创新绩效具有显著的正向影响，而校校合作创新和校研合作创新对合作创新绩效的影响并不显著。接下来聚焦校企合作创新，发现校企合作创新的领域和学科契入点会对合作创新绩效产生影响。研究结果为深化校企合作创新提供了实证支持，同时也证明了合作模式、合作领域和学科契入点是影响合作创新绩效的三个重要因素，为合作创新的发展路径提供了指引与参考。通过政策梳理，借鉴美、英、日、法四国的合作创新政策，结合实证分析，在政府、企业和高校三个层面为我国提出建议。