湿地是人类最重要的生存环境和自然界最丰富生物多样性的生态景观之一。然而，近年来一些地区的湿地状况令人担忧。从组织结构到功能过程，从微观到宏观，从基因到种群群落，湿地生态系统正遭受着前所未有的冲击。湿地数量和面积减少、生物多样性降低、水质恶化、富营养化等，已经威胁到人类自身的发展。以乌梁素海为例，由于该地区近年来工业化、城镇化进程的加速带来的工业废水及城镇生活污水以及农业退水的大量排放和湖泊自身因素的影响，导致乌梁素海湖泊富营养化严重，水域生态环境恶化。本文通过生态系统长期定位观测研究站的基本要求，进行乌梁素海湿地现状特征分析，从污染源，污染现状、面积萎缩状况和环境背景等进行了分析，基于此基础上，对乌梁素海的湖区水量平衡进行了计算，分析了污水厂和再生水厂建成后入湖水质和水量的变化，重点分析了入湖水质的特点。同时确定了乌梁素海生态定位站监测指标体系的构建，对总体布局、监测指标，仪器设置，分期规划等做了阐述。建立指标体系的基础上，充分考虑乌梁素海的实际情况，建立乌梁素海生态健康评价指标体系。通过分级标准和评价指标权重的确立，利用模糊评价，确立乌梁素海生态健康评价为亚健康。