BL21(DE3)菌株rimJ基因敲除与Nα-乙酰转移酶底物特异性研究

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N-末端乙酰化修饰是蛋白最主要的修饰方式之一,本文主要内容是研究乙酰化酶基因rimJ缺失对大肠杆菌BL21(DE3)生长的温度敏感性影响以及两种原核乙酰化酶RimJ和NAT的底物特性。一、通过设计长度为1000bp的同源臂构建打靶质粒,利用0.2%的L-阿拉伯糖诱导辅助质粒表达SceI归巢内切酶将打靶片段切下并在Red同源重组酶的作用下将打靶片段替代目标序列得到rimJ敲除菌。通过测定出发菌和敲除菌在不同温度下(25℃、37°C、42°C)的生长曲线,比较不同温度下的最大比生长速率,利用t值分析这两株菌的比生长速率,结果无显著差异;在高倍显微镜下观察两株菌在不同温度下的形态也无差异;同时将Tβ4融合蛋白分别在两株菌中表达,分析两株菌表达外源蛋白的能力。测定结果表明两株菌在三个温度下的最大比生长速率无显著性差异、不同温度下的菌体形态以及表达外源蛋白的能力基本无差异。说明rimJ基因的缺失对大肠杆菌E.coli BL21(DE3)菌株生长的温度敏感性没有影响。二、通过镍柱亲和层析、透析处理得到纯度大于90%的乙酰化酶RimJ和NAT,选择8种蛋白的N末端六肽为其作用底物,DTNB作为显色物质利用分光光度法检测两种酶分别作用的底物,测定其底物专一性;同时将RimJ和NAT分别与Tβ4融合蛋白、ESAT-6共表达,通过镍柱亲和层析、反向高效液相色谱技术得到高纯度的蛋白纯品,利用Q-ToF质谱技术得到共表达的Tβ4融合蛋白、ESAT-6的分子量。在412nm处检测,结果显示对照组吸光值均低于0.05,而RimJ可以乙酰化Tα1(0.274)、ESAT-6(0.132)、S5(0.177)三种六肽;另外一种NAT可以乙酰化Tal(0.214)、Tβ4(0.204)、ESAT-6(0.159)、S5(0.123)、S 18(0.148)、L12(0.218)、EF-Tu(0.125)七种六肽。RimJ和NAT都可以在体内将Tβ4融合蛋白乙酰化。两部分实验表明该乙酰化酶NAT具有更广泛的底物特性。
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