分泌型激酶Fam20C在较低级别胶质瘤预后评估中的作用研究

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目的胶质瘤是原发中枢神经系统的恶性肿瘤。根据WHO分级不同,预后也不同,对于WHOⅡ-Ⅲ级这部分较低级别胶质瘤(LGG)患者的生存预后也存在着较大差异。准确诊断恶性程度及判断预后是为胶质瘤患者术后制定辅助治疗方案的重要依据。Fam20C是近年来发现的一个新型分泌激酶,通过蛋白质磷酸化修饰参与细胞周期的信号传导通路。目前通过对公共数据库的数据挖掘及分析是近年来肿瘤研究领域的热点。本文利用公共数据库数据库数据及本院临床标本的数据,分析Fam20C基因表达与较低级别胶质瘤临床进展的关系,并进行功能富集分析,了解基因功能及信号通路,对肿瘤的发病机制提供新见解,从而为临床治疗方案提供新思路。方法我们首先从TCGA及CGGA官网下载LGG的Fam20C基因表达数据及临床数据,使用R软件进行统计分析与应用,所有临床病理特征与Fam20C表达之间的校正采用Wilcoxon符号秩检验,使用R中的Survival和Survminer包,通过kaplan-Meier分析比较高表达组和低表达组的总生存率(OS)的差异,利用R中Survival包含有的Log-rank检验计算p值,使用R中的survival ROC包生成受试者工作特征(ROC)曲线。采用单变量Cox分析确定潜在的生存率,多因素Cox回归比例风险模型用于在校正了相应的协变量后,比较Fam20C表达对总生存率和无病生存率的影响,分析确定Fam20C表达作为LGG患者OS的独立危险因素。并对我院的临床标本进行免疫组化分析及HE染色,通过对临床数据的分析进一步验证数据库的结果。最后对Fam20C进行基因功能富集分析。结果在TCGA、CGGA及我院的临床标本中Fam20C在LGG中均过表达,Fam20C的表达升高与临床进展相关,且较高的Fam20C表达与较差的OS显著相关。单因素分析显示,Fam20C高表达与OS差显著相关。多因素分析显示,LGG患者Fam20C的高表达与OS显著降低独立相关。受试者工作特征曲线分析显示Fam20C具有较高的诊断价值。GO和KEGG富集分析显示,共表达基因主要与细胞外基质重塑的生物学过程密切相关,相关信号通路主要富集于细胞外基质受体相互作用、细胞黏附、细胞凋亡、癌症通路、P53信号通路、NOTCH信号通路及细胞周期等信号通路。结论本研究基于TCGA和CGGA 2个数据库和我院临床样本建立了LGG患者潜在的预后特征。这一特征可以有效地将LGG患者分为两组,生存预后明显不同。此外,我们还发现了Fam20C在LGG患者中的潜在信号通路。过表达的Fam20C提示LGG患者恶性进展和生存期较差,但也揭示了LGG细胞外基质受体相互作用、细胞粘附和细胞凋亡明显富集。Fam20C可能成为临床判断预后的有效分子标志物,并可能是防治LGG的潜在靶标。抑制Fam20C可能是阻止LGG进展的一种可能的治疗策略。
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