伴随着全球人口的增长以及经济全球化的发展，传染性及流行性疾病不断地在全球蔓延，公共健康危机成为全球面临的严峻问题。随着医药产品和方法纳入TRIPS协议专利的保护范围，关于药品专利保护与公共健康危机问题就一直是备受争议的问题。在探索提高药品可及性、缓解公共健康危机的途径上，作为能够有效缓解公共健康危机的方式之一，专利药品的平行进口问题在理论上和有关国家的实践中都备受争议，其合法与否TRIPS协议最终也没有做出明确的规定，而是将其赋予成员自己决定。本文从专利药品平行进口的基本理论问题入手，分析理论和实践上关于专利药品平行进口存在的争议，分析专利药品平行进口对缓解公共健康危机的重要作用及其可能的负面影响，对专利药品平行进口所涉及的主要利益主体的利益关系进行分析并从利益衡量的角度分析公共健康危机下专利药品平行进口的合理性，同时，意识到专利药品平行进口潜在的问题及其面临的实践障碍将大大减损其缓解公共健康危机的作用，文章最后试图探究相应的解决思路，以期使专利药品平行进口得到有效合理的利用。本文共分三个部分：第一部分是对专利药品平行进口与公共健康关系的探讨。该部分涉及三个方面。首先分析专利药品平行进口的表现形式及相关理论问题，研究专利药品平行进口产生的根源以及关于专利药品平行进口合法与否的权利穷竭理论及实践争议；其次，分析目前全球公共健康状况，说明在TRIPS关于药品的现有保护标准下，发展中国家及最不发达国家的药品可及性问题。再次，分析专利药品平行进口对降低药品价格，缓解公共健康危机的作用以及发达国家和发展中国家在此方面的不同看法。从该部分可以看出，对于专利药品的平行进口，由于涉及不同利益主体复杂的利益关系，对于其是否应当得到允许存在很大争议。第二部分是对专利药品平行进口的利益分析。本部分主要是从分析专利药品平行进口所涉及的不同主体的利益冲突角度入手，分析争议背后的实质，并从这些争议的利益关系入手，在价值衡量、利益协调的基础上得出专利药品平行进口的合理性。首先，从微观角度上讲，争论的焦点在于平行进口涉及到知识产权权利人与公众之间的利益冲突。在药品专利权人看来，其巨大的药品研发成本及营销成本使其必须要获得药品专利保护的垄断利益，而专利药品平行进口恰恰减损了药品专利权人的市场垄断利益；在社会公众看来，在公共健康问题上，专利药品平行进口对公众的利益影响不仅仅是享受低廉的价格所带来的经济上的便利，更多了其他价值上的考量。在药品专利权人私权与社会公众公益发生碰撞时，如何衡量和取舍直接关系到一国对专利药品平行进口的态度。为维护社会公共利益，药品专利权人的私人利益必须受到必要的限制，在此种利益衡量下，专利药品平行进口有了其合理性。其次，进口国专利权人与平行进口商之间的利益关系分析，这是药品专利平行进口中在微观层面涉及的最直接的利益关系。在这里，涉及到公共健康问题，反对药品专利平行进口行为的人将更多的关注放在了专利药品平行进口商的牟利行为可能无法实现专利药品平行进口的初衷。最后，从宏观层面上，专利药品平行进口涉及进口国与出口国之间的利益关系，这又集中反映在发展中国家与发达国家的利益冲突。代表制药行业利益的发达国家必然要求对药品实行高标准的知识产权保护，而发展中国家的健康状况以及药品可及性现状使其在面对公共健康问题时要求通过专利药品的平行进口来提高国内药品可及性。面对二者的利益冲突，分析在药品专利保护上整齐划一的国际保护标准实际造成了发达国家与发展中国家的利益失衡，从利益平衡的角度上看应允许发展中国家根据国情对药品专利保护做出必要的限制，允许专利药品平行进口。第三部分是运用专利药品平行进口缓解公共健康问题的实践障碍及其解决思路。该部分涉及两个方面，一是阐述运用专利药品平行进口缓解公共健康问题的实践问题。在运用专利药品平行进口缓解公共健康问题的实践中，主要面临以下几个问题和障碍：由于制药商的抵制所导致的进口来源缺失问题，面临来自发达国家的抵制问题，面临对药品创新研发的挫伤问题以及平行进口商滥用专利药品平行进行牟利的问题。这些实践问题和障碍的解决将直接影响到专利药品平行进口缓解公共健康问题的效果。因此，二则是在此基础上提出解决障碍的思路、路径，提出了通过补偿和激励机制的创新以给予专利权人必要的经济补偿、对发展中国家的现实保护、加强对平行进口商滥用专利药品进行获利行为的控制等解决思路，以期实现专利药品平行进口的合理有效利用，真正实现缓解公共健康危机的初衷。