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猫细小病毒病和犬细小病毒病分别由猫细小病毒（Feline Parvovirus,FPV）和犬细小病毒2型（Canine Parvovirus,CPV-2）引起的急性烈性传染病。FPV是食肉目动物细小病毒的原型病毒,可感染多数食肉目动物,但不感染犬。1978年,起源于FPV的CPV-2（original CPV-2）首次从犬中分离和鉴定。目前,CPV-2在全球流行,病毒不断进化并形成了多个变种:CPV-2a、CPV-2b和CPV-2c。original CPV-2能感染犬但失去了感染猫的能力,而变种CPV-2a/2b/2c重新获得了感染猫的能力。虽然CPV-2是DNA病毒,但VP2基因的进化速率约10-4次置换/位点/年,与一些RNA病毒的速率相当。为了监测CPV-2的流行和进化情况,本研究对广东省两大城市广州市和深圳市的猫、犬细小病毒进行了病原学调查,成功分离16株猫源细小病毒和18株犬源细小病毒。结果表明,FPV和CPV-2均为猫细小病毒病的重要病原,犬群中呈现CPV-2a/2b/2c多变种流行的形势。通过进化树分析,首次提出了FPV和CPV-2的进化树分支依据,提出了FPV（包括FPV、MEV、BFPV和RPV）和CPV-2（包括original CPV-2和CPV-2a/2b/2c）两个主要进化树分支,且这两分支并没有形成可靠的亚分支的观点。通过VP2的氨基酸序列系统性分析,得到结果:第一,完善了病毒进化特征:去除了把VP2的555和375氨基酸位点作为变种间特征性突变位点的认知;发现了FPV在101氨基酸位点存在I和T两种氨基酸的多样性情况（现有报道认为只有I）。第二,提供了一个备选的科学分型方法,为将来的病毒研究提供实质性参考。第三,描述了CPV-2的不同变种在全球的分布特征:全球呈现为CPV-2a\2b\2c多变种流行形势。另外,CPV-2a在亚洲为优势流行变种,CPV-2c在欧洲和拉丁美洲为优势流行变种。第四,零星出现的CPV-2-like毒株可能来源于疫苗病毒。第五,发现VP2基因3个氨基酸位点（F267Y、Y324I和A440T）的趋势性突变位点和其重要性。Original CPV-2不能感染猫,而广泛流行的CPV-2a/2b/2c重新获得了感染猫的能力。由本研究中病原学调查可见,FPV和CPV-2均为猫细小病毒病的重要病原。另外,报道称在东南亚地区CPV-2引起的猫细小病毒病占比达到约80%。然而,FPV和CPV-2对猫的感染机制并不完全清楚。宿主micoRNAs（miRNA）通过作用靶基因,直接或间接调控大量生命过程。对FPV和CPV-2感染猫后宿主miRNA的调控研究或将有助于防控和治疗猫细小病毒病。为此,本研究通过应用HiSeq2500高通量miRNA测序的研究方法,鉴定了FPV和CPV-2感染猫的空肠组织与阴性猫空肠组织之间的差异miRNA,进一步通过生物信息学方法分析和挖掘其中的分子机制,结果发现:第一,FPV和CPV-2均引起猫系统性和致死性的感染,病毒在空肠组织中大量复制和引起空肠组织的严重病变。第二,首次鉴定了猫源miRNA,为mi RNA数据库填补空缺。检测和验证了FPV和CPV-2感染猫后的空肠组织中共同上调10个miRNAs,共同下调24个miRNAs。第三,筛选的34个miRNAs富集于大量的KEGG通路之上,其中,JAK-STAT信号通路为重要富集通路。第四,JAK-STAT信号通路上,共有5个下调的miRNAs和2个上调的miRNA通过靶向8个基因而影响JAK-STAT信号通路。这些mi RNAs值得开展进一步的功能验证和研究。干扰素（Interferons,IFNs）是重要的抗病毒细胞因子。病毒感染后,病原体相关分子模式（pathogen-associated molecular patterns,PAMPs）可激活干扰素应答,分泌I型干扰素,然后通过JAK-STAT信号通路刺激产生具有拮抗病原效应的干扰素刺激基因蛋白（interferon-stimulated genes,ISGs）。本研究旨在探索FPV和CPV-2在干扰素信号通路中的作用机制。结果发现:第一,通过qPCR方法发现FPV和CPV-2均抑制ISGs的表达。第二,成功克隆了猫IFN-β启动子,建立了猫IFN-β启动子双荧光素酶报告系统。通过该系统,证实了FPV和CPV-2通过NF-κB和IRF3通路激活IFN-β启动子。同时,通过qPCR方法发现FPV和CPV-2引起IFN-α和IFN-β的mRNA上调。第三,发现了FPV和CPV-2引起fca-mir-5的上调表达;证明了fca-mir-5靶向JAK-STAT信号通路中关键蛋白TYK2;证明了过表达fca-mir-5后抑制了Sev刺激细胞表达ISGs和沉默fca-mir-5后使FPV和CPV-2能引起部分ISGs的上调。总之,本研究揭示了FPV和CPV-2刺激fca-mir-5的上调表达,从而阻断JAK-STAT信号通路和抑制ISGs蛋白表达的机制。