DNA序列的图形表示及其应用

来源 :渤海大学 | 被引量 : 4次 | 上传用户:woai12086
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
生物信息学作为21世纪自然科学的一门核心科学,采用数学的方法,运用计算机技术对生物学数据进行处理、存储、分析和解释,挖掘出隐藏在其中的生物学规律,并运用实验加以验证。近年来,随着DNA测序技术的快速发展,生物学序列数据的数量以爆炸式的方式增长,生物序列的图形表示及其在生命科学与技术领域的应用已经成为计算生物学和生物信息学中的一个热门话题。本文将在序列比较方面进行研究,主要内容如下:通过将双碱基视为多重集{∞·A,∞.G,∞.C,∞.T}的2-组合,提出了一种新的DNA序列的3-D图形表示,同时给出了它在(x,y),(y,z)和(x,z)平面上的投影。此外,基于“分段函数”的思想,构造了基于细胞的描述子向量来数值地刻画DNA序列。对4个数据集的相似性分析证明了我们方法的有效性。
其他文献
昆虫幼虫的腹足在数量和排列上有很大的差异,而这种多样性被认为是对环境的功能性适应,是自然选择的结果。因此,对于腹足同源性及起源的研究有助于我们揭示其起源和进化过程
介形类隶属于节肢动物门甲壳动物亚门介形纲,是一种小型水生动物,其在生态学、地质学、古生物学及进化生物学研究中具有重要的应用价值,甚至于被一些学者称作“进化生物学中
漆酶是一类含铜的氧化还原酶,它能催化酚类化合物,将酚类化合物进行单电子氧化,形成酚自由基,进而产生非酶催化的自由基反应。由于漆酶特殊的催化性能和广泛的底物范围,在生物技术
蛋白质相互作用的预测在所有的生物过程中都扮演着非常重要的角色,蛋白质之间通过相互作用形成蛋白质复合物,同时执行着不同的生物进程,包括酶的催化、免疫反应、内分泌功能
量子光学的一个重要课题是研究光场与物质相互作用系统中的量子特性。对于这些量子特性的衡量指标有很多,保真度就是其中之一,可以描述量子态在信息传输或者量子计算中初态与
具有回音壁模式(WGM)的光学微球腔可以把光的能量限制在极小的体积内较长的时间而几乎没有损耗,因此兼有极高的品质因子和极小的模式体积。这一性质很大程度地增强了微球腔的
开口箭(Tupistra chinensis Baker)为百合科开口箭属植物,别名竹根七、岩七[1]。主要分布于中国的南方,如湖北、湖南、福建、江西、浙江、河南、安徽、陕西(秦岭以南)、四川
多年来受自然因素和人为因素的共同影响,黄土丘陵区的天然植被遭到严重的破坏,水土流失问题十分严重,生态环境在一段时期内不断恶化,已经对生态环境和农业的可持续发展造成严
胚胎干细胞(Embryonic Stem Cells, ESCs)可以在体外进行自我复制式的增殖(自我更新),并且同时保持着能够分化成有机体各种类型细胞的能力,因此胚胎干细胞ESCs在再生医学领域
模压形变法是一种新型且具有强烈晶粒细化能力的大塑性变形方法,它可以在几乎不改变板状材料截面形状的情况下,获得亚微米甚至纳米级的超细晶组织,改善材料的综合性能。本文