安格斯牛生长性状相关基因多态性及关联分析

来源 :宁夏大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:piaoye2008
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生长激素受体基因(GHR)、解耦联蛋白家族基因(UCPs)、FBXO32基因和细胞周期蛋白基因(Wnt8a)在维持动物正常生理生化机理的平衡和生长发育方面发挥着至关重要的作用。为了验证5个基因的8个SNPs是否影响宁夏地区安格斯牛的生长性状。本研究以宁夏地区5个牛场1126头20月龄左右的安格斯牛为研究对象,利用Sequenom SNP实验技术对GHR、UCP2、UCP3、FBX032和Wnt8a基因的SNP位点进行基因分型检测,统计分析各个SNP位点相关群体遗传信息,并将SNPs与安格斯牛生长性状拟合进行关联分析。研究结果如下:1.本研究通过Sequenom SNP实验分型技术对8个SNPs进行基因检测分析后发现,所选择的基因位点在宁夏地区安格斯牛群体中都存在多态性。其中GHR-149、UCP2-655和FBXO32-53423位点均属于中度多态(0.25<PIC<0.5)。除UCP3-5465位点,其他突变位点经卡方检验后发现,都处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。2.GHR-149(g.149A>G)位点与安格斯牛的体高和十字部高显著相关,其中AA型个体的体高和十字部高均值都显著高于AG和GG型个体均值(P<0.05);UCP2-655(g.655G>A)位点与安格斯牛的胸围和腹围显著相关,其中AG型个体的胸围、腹围的均值都显著高于AA和GG型个体均值(P<0.05);UCP3-5465(g.5465G>A)位点与安格斯牛的体重显著相关,其中GG型个体的体重均值显著高于AG型个体体重的均值(P<0.05);FBXO32-53423(g.53423A>G)位点与安格斯牛的体斜长显著相关,其中AA和AG型个体的体斜长均值都显著高于GG型个体体斜长的均值(P<0.05);Wnt8a-910(g.910A>G)位点对安格斯牛的胸围有显著影响,其中AA基因型个体胸围均值显著高于AG基因型个体胸围的均值(P<0.05)。3.连锁不平衡和单倍型分析发现,Wnt8a-244和Wnt8a-910两个位点处于完全连锁不平衡状态,UCP2-655、UCP3-7921和UCP3-8018三个位点处于强连锁不平衡状态。发现Block 1当中的H1(CA)单倍型频率最高,为96.8%。Block2当中的H3(AGC)单倍型频率最高,为79.9%,并且UCP2-655、UCP3-7921和UCP3-8018位点组成的单倍型H3(AGC)对安格斯牛的体高和胸围性状有显著影响(P<0.05)。本文的研究结果对于进一步了解、掌握安格斯牛在引入宁夏地区以后的生长发育情况、开辟正确利用途径,筛选验证影响其生长性状的SNP位点,对更好发挥品种效应具有重要意义,同时为其分子标记辅助选择提供参考。
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