由于现实科学问题复杂性的凸显和传统基础学科领域之间交叉趋势的发展，近年来涌现了大量的交叉科学。如何把握交叉科学的发展方向并评价其发展对其他学科领域的影响，对于相关科技管理机制和政策制定、教育与科技资源合理优化以及国家科技发展整体布局具有重要的参考意义。在不同科学领域知识融合和技术会聚的过程中，新兴交叉主题研究也不断涌现。如何识别特定学科领域的新兴交叉主题，并探究其引文扩散规律成为了解特定学科领域发展方向和评价对其他学科领域影响的重要问题。本研究创新性地构建了基于文献不同章节的学科交叉度、参考文献的重要程度和同一参考文献的多次引用等因素的文献加权学科交叉测度模型和高学科交叉文献识别方法。在高学科交叉文献的基础上，进一步综合学科交叉特征和新兴性特征构建了新兴交叉主题识别模型，并以计算生物学领域为例进行了新兴交叉主题识别和引文扩散特征研究。
　　具体来说，本研究主要分为三个部分：第一，针对目前从文献全部参考文献视角测度学科交叉方法存在的不足，本研究基于文献的章节参考文献视角，利用熵值法计算不同章节参考文献的重要程度，提出了综合文献不同章节的学科交叉度、参考文献的重要程度和同一参考文献的多次引用等因素的加权学科交叉测度方法，最后综合文献全部参考文献和章节参考文献两个视角下的学科交叉度识别出计算生物学领域的高学科交叉文献。第二，对识别出的高学科交叉文献进行主题词的提取和清洗，并进一步构建主题词共现矩阵，通过主题词之间的关联强度进行主题可视化聚类分析，最终构建了新兴交叉主题测度模型，并对计算生物学领域的新兴交叉主题进行识别。第三，针对获取到的计算生物学新兴交叉主题，从引文扩散的学科分布特征和时间特征两个方面探究其影响情况。研究发现：综合文献全部参考文献和章节参考文献两个视角下的学科交叉度能够有效识别核心章节具有高学科交叉的文献。通过新兴交叉主题的识别研究，共识别得到计算生物学领域的13个新兴交叉主题，主要涉及基因结构功能关系、大分子结构与功能、遗传与进化、生物体免疫反应，疾病的发生机理与诊断治疗等方面的相关研究。从引文扩散的学科分布特征来看，这些新兴交叉主题的引文扩散范围较广，涉及学科数量较多，但是分布却不均匀，主要集中在基因与遗传学、生物化学与分子生物学、微生物学等8个学科；除此之外，每个主题的引文都会各自向一些与自身内容高度相关的特定学科领域扩散。从引文扩散的时间特征来看，新兴交叉主题研究的引文扩散学科领域数量呈现逐渐增加的趋势，引文扩散范围和程度逐渐加深，但不同新兴交叉主题对同一学科的引文影响存在差异，同一新兴交叉主题对不同学科的引文影响程度也不相同。
　　本研究通过文献全部参考文献和章节参考文献两个视角下的学科交叉度识别高学科交叉文献的方法，弥补了单一基于文献全部参考文献视角下不能综合考虑文献不同章节的学科交叉度、参考文献的重要程度和同一参考文献的多次引用等因素测度文献学科交叉的不足，为学科交叉文献的识别研究提供了新的研究视角和思路。其次，通过综合主题学科交叉性和新兴性两个特征，建立相关识别模型对新兴交叉主题进行识别，丰富了新兴交叉主题识别研究理论，有助于完善主题识别研究体系；最后，通过实证研究探明了目前计算生物学领域的新兴交叉主题和其引文扩散的学科分布特征和时间特征，为该学科的发展建设和对其他学科的影响评价提供了参考与依据。