短视频作为新兴的网络视听形式,备受广大网民的欢迎。人们的注意力逐渐从电脑端的大屏幕转移到移动智能终端的小屏幕,利用“碎片化”的时间观看短视频已成为主流。当前媒介由一对多转变成多对多的扁平化传播模式,进而开辟了自媒体与短视频结合的科普传播新渠道。同时,自媒体平台的科普动画短视频拓展了科普传播效力。针对目前知识类短视频中科普自媒体个人创作者生产力不足的问题,将节拍表与文案结构相融合,对科普动画短视频进行脚本结构化设计与创作研究。本文将从三点来进行论述:首先,通过调研与分析当下的科普动画短视频发展历程及现状,目前国内的科普动画短视频进入快速发展阶段;并挖掘在此阶段国内外自媒体平台上的优秀案例,对比剖析,分析在科普动画短视频结构化设计上仍存在的问题。其次,优化科普动画短视频的创作要素及策略,将节拍表与文案结构融合进行脚本创作,提出适用于自媒体平台的科普动画短视频的创作方法。最后,确定科普策划选题,结合自身的创作实践进行检验与评估,反思科普动画短视频创作方法的优势与不足。希望本论文的论述与研究,对国内自媒体平台的科普动画短视频创作具有一定的借鉴意义。