水稻种传细菌的检测及鉴定

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水稻种子携带细菌常能引起稻谷变色、抑制稻种的萌发,影响水稻不同生育期的生长发育并易引发病害,致使水稻产量损失严重。而有益细菌可通过在水稻内的繁殖,促进水稻生长或发挥生防作用。近年来在湖南省推广的水稻品种繁多,对于种传细菌尚缺乏系统报道。为此,本研究对湖南省和其他地区的部分水稻栽培品种的种样进行了细菌分离培养及菌种鉴定,初步明确了水稻种传细菌的种类及其分离频率,为今后开发出对水稻具有有益作用的细菌提供有效信息和菌种资源,同时也为种子细菌检验处理和早期病害防治等工作奠定理论基础。1、水稻种传细菌的检测分离培养结果表明,所有水稻品种上均检出细菌,但不同品种的带菌率存在差异。籼型三系杂交水稻种子中金优217、深优95]2、Ⅱ优838三个品种的带菌率较低,分别为14.29%、16.67%、16.67%;品种青优109、T优109带菌率最高,为95.24%、92.86%。籼型两系杂交水稻种子中C两优501及Y两优696两个品种的带菌率最低,均为19.05%;品种陵两优211的带菌率最高,为85.71%。常规杂交水稻种子中农香18带菌率最低,为28.57%;五优稻1(粳型)和湘晚籼12号带菌率最高,为59.52%。不同来源的同种水稻品种种子的带菌率不同,种子带菌率与杂交亲本无直接关系。本研究发现水稻种子储藏期间细菌被高频率检出,许多种子表面已变褐色或黑色,说明储藏期细菌可使稻谷质量变劣,可能在早稻育秧期间造成烂秧,尤其是在温室育秧的条件下。2、水稻种传细菌的鉴定对种子细菌进行分离培养和分子鉴定后,结果表明,泛菌(Pantoea)的分离频率最高,为75.39%;芽孢杆菌(Bacillaceae)、甲基杆菌(Methylobacterium)、颖壳假单胞菌(Pseudomonas glumae)、食酸菌(Acidovorax)的分离频率最低,均为0.04%。对分离到的菌株进行16SrDNA扩增实验,产物测序及BLAST比对,检测出水稻种子中黄单胞菌(Xanthornonas)、颖壳假单胞菌(Pseudomonas glumae)、成团泛菌(Pantoea agglomerans)三种致病性细菌。还有一些内生细菌,包括假单胞菌(Pseudomonas)、土壤杆菌(Agrobacterium)、短小杆菌(Curtobacterium)、芽孢杆菌(Bacillaceae)、鞘氨醇单胞菌(Sphingomonas yabuuchiae)、赫氏埃希菌(Escherichia hermannii)、甲基杆菌(Methylobacterium)、食酸菌(Acidovorax)、肠杆菌(Enterobacter)、中型假食酸菌(Pseudacidovorax intermedius)、微杆菌(Microbactium)。同种细菌在不同水稻品种上的分离频率存在差异。水稻细菌性病害可通过种子传病,危害水稻各个生长期的正常发育。一是泛菌引起秧苗立枯病。泛菌侵染水稻种子抑制稻种萌发,影响稻谷的灌浆与发育;水稻在孕穗期到抽穗初期易被感染,致使抽穗迟、白穗、稻粒变色,严重时叶鞘软腐坏死,秧苗期容易造成死苗;二是水稻细菌性条斑病和白叶枯病在大田引起叶片发病。带菌种子播种后在大田期可引起严重的水稻检疫性病害,致使叶片枯黄凋萎、稻穗不实,水稻产量损失严重。创新点:(1)明确了湖南省及其它地区118个不同水稻品种种子的带菌率;(2)明确了不同水稻栽培品种的所带菌种和各细菌在不同水稻品种种子上的分布结构,并对分离到的菌株进行测序,建立了rDNA-16S系统进化树。
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