管蚜蝇亚科（Eristalinae）隶属于食蚜蝇科（Syrphidae）,是该科中物种最丰富的亚科,具重要生物学意义。之前关于其系统发育关系的研究多使用形态学数据及少量分子数据,但部分物种形态特征较为相似、少量分子数据所包含遗传信息不够充分,导致该亚科内各族属间存在亲缘关系不够明确的问题。线粒体基因组因其稳定、进化速率快、母系遗传等特性,可为该亚科内各族属间系统发育关系和单系性的阐明提供新的研究方向。本项目基于二代测序技术,对8个管蚜蝇亚科（Eristalinae）物种、1个蚜蝇亚科（Syrphinae）物种及1个缩颜蚜蝇亚科（Pipizinae）物种线粒体基因组进行测定。结合Gen Bank获取的24条线粒体基因组序列（23个管蚜蝇亚科物种及1个蚜蝇亚科物种）,对34条序列的组成结构、序列长度、碱基含量、蛋白编码基因、转运RNA（t RNA）基因、核糖体RNA（r RNA）基因及非编码区进行比较线粒体基因组的分析。基于所得线粒体基因组数据,选择5个数据集,2种建树方法展开系统发育研究,同时也从Gen Bank获取了部分物种的28S r RNA基因,构建进化树,进行分析。主要研究结果如下:1.对10个物种进行线粒体基因组测序,完成组装、注释、比对与相关分析。2.所测物种线粒体基因组均为环状闭合双链结构,序列长度在15719bp-15965 bp之间。共包含13个蛋白编码基因、22个t RNA基因、2个r RNA基因及一段非编码区。3.所测物种的线粒体基因组排列顺序均较为保守,与亚库巴果蝇（Drosophila yakuba Burla,1954）的基因排列方式相同。未发生基因重排现象。但基因间隔与重叠现象在各基因间较常发生。4.所测物种线粒体基因组AT含量在79.7%-81.3%之间,均显著高于GC含量,表现出明显的AT偏向性。5.蛋白编码基因起始子大多为标准的三联体ATN（ATA、ATT、ATG、ATC）,其中COX1起始子多为CGA与CAA,ND5起始子多为GTG,ND1起始子多为TTG。大多数基因的终止子为TAA或TAG,其中COX1、ND5与ND1多以不完整的单T或TA密码子作为终止子。6.t RNA-Ser1缺失DHU臂,其余的t RNA基因均为典型的三叶草型二级结构。碱基错配现象在t RNA基因中时常发生,出现最多的错配类型为U-U错配,在所测个体中共发生44次。除此还存在U-C、A-A和A-C三种错配类型,U-C错配出现3次,A-A、A-C错配均只出现1次。7.对34个物种基于Complete mitogenomes、PCG、PCGRNA、PCG12及PCG12RNA数据集分别构建ML和BI进化树,所选物种分成3支分别为:蚜蝇亚科Syrphinae、管蚜蝇亚科Eristalinae及缩颜蚜蝇亚科Pipizinae,10个进化树均支持管蚜蝇亚科Eristalinae为单系群。基于28S r RNA基因构建的进化树则支持管蚜蝇亚科Eristalinae为复系群。8.基于PCG12数据集构建的ML和BI进化树构型一致且置信度较高,管蚜蝇亚科Eristalinae内的系统发育关系为:鼻颜蚜蝇族Rhingiini+（（蜂蚜蝇族Volucellini+（短腹蚜蝇族Brachyopini+齿腿蚜蝇族Merodontini））+迷蚜蝇族Milesiini+管蚜蝇族Eritalini）。9.基于Complete mitogenomes、PCG、PCGRNA数据集构建的6个进化树均支持木蚜蝇属Xylota单独成木蚜蝇族Xylotini。基于PCG12、PCG12RNA数据集所构建的4个进化树则均不支持木蚜蝇属Xylota独立成为木蚜蝇族Xylotini,支持其划分至迷蚜蝇族Milesiini中。