科研经费是知识生产、科技创新的基本条件和重要保障,是科学研究顺利开展的物质基础之一。随着我国高等教育活动规模的不断扩大,高校获得的科研项目数量和研究经费也出现了明显的增长趋势,科研经费已经成为学校经费的主要来源。科研经费管理的核心是预算管理,在财务管理中占据着重要的地位。怎样联系学校的实际情况,规范科研经费管理,提高科研经费管理水平,对于保证高校科研工作有序、高效的进行,提高科研经费的使用效率,是一件有着重要意义的事情。本文以高等学校科研项目经费预算管理为研究主题,选取G高校为研究案例,以预算管理理论、委托代理理论、绩效评价理论为基础,针对预算管理的全过程：预算编制、预算执行、预算控制、预算考核进行全面分析,并结合了国外发达国家成熟的科研经费预算管理理念,从不同方面提出了多种完善G高校科研项目经费预算管理的建议。通过提出这些建议,全过程支持了科研项目经费预算管理,对G高校科研项目经费预算管理进行了优化,旨在于提高经费使用效率,不仅要保证G高校的科研项目经费能够顺利完成研究任务,还要降低经费的使用成本。文章通过调研发现,G高校在项目经费预算管理方面主要存在着预算编制不符合科研实际需要、经费支出与预算不符、预算控制力度不够、缺乏预算绩效考核办法等问题,并就存在的问题深入分析其成因,发现主要是因为制度管理不完善且对经费预算管理的重视度不够。最后在借鉴国内外科研项目经费管理经验的基础上,提出了加强预算编制管理、严格预算执行、提高预算控制力和建立绩效考核办法等措施。