不结球白菜分子遗传图谱构建及数量性状位点分析

来源 :南京农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tobay1
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
不结球白菜(Brassica campestris ssp. chinensis Makino)是十字花科(Cruciferae)芸薹属(Brassica)芸薹种(B. campestris, syn. B. rapa,染色体组AA,2n=2x=20)中的一个亚种。它原产中国,是长江中下游各大、中城市最重要的叶菜类蔬菜之一分子标记连锁图谱的构建和重要农艺性状QTL定位将为不结球白菜基因组结构研究及遗传育种提供有益参考。本研究通过游离小孢子培养获得了不结球白菜DH群体,构建了分子标记连锁图谱,并在此基础上进行硝酸盐含量和主要经济性状的QTL定位研究。为建立高效的不结球白菜游离小孢子培养体系,构建永久作图群体,以7个不结球白菜杂交种为试材,采用游离小孢子培养方法,研究了培养基和培养条件对胚状体发生、发育和再生植株的影响,探讨了小孢子植株倍性鉴定方法。各基因型间小孢子胚胎发生能力差异显著,最高出胚率(18.13胚·蕾-1)是最低出胚率(2.07胚·蕾-1)的近9倍。小孢子胚诱导率随供体植株的开花时期而呈现明显变化,于植株第1朵花开花后6-10 d培养,小孢子胚诱导率可达各基因型的最高水平,11-15 d培养次之,于开花前(<0 d)和开花>20 d接种,小孢子胚诱导率均较低,甚至得不到胚状体。添加活性炭能明显提高小孢子胚诱导率,而不同基因型对最适活性炭浓度的要求不同。基因型同时影响小孢子胚的再生成苗率,胚胎发生较易的基因型成苗率较低,胚胎发生较难的基因型成苗率较高。在液体培养基中培养25 d的胚状体在固体培养基上发育最快,成苗率最高(37.8%),因此及时地将成熟的胚状体转移至固体培养基上,对提高植株获得至关重要。琼脂浓度从0.8%提高到1%和1.2%,能大大提高成苗率。低温处理10 d能显著提高胚状体成苗率。结合流式细胞仪和田间形态两种倍性鉴定方法,结果表明在所研究基因型的小孢子后代中,都以二倍体为主,单倍体其次,还有少量四倍体或其他混倍性的材料。利用不结球白菜‘寒笑’和‘矮抗5号’游离小孢子培养所获得DH群体进行基因型分析,发现SRAP、SSR和RAPD 3种标记均出现较高比例的偏分离,且来源于两个亲本的标记座位在群体中的分离比例在P=0.05水平符合1:1。每个位点上,两个亲本基因频率的平均值比较接近,并没有发现有严重偏向某一亲本的现象,说明该群体总体上未出现严重的偏分离,可以用于遗传图谱的构建及QTL定位研究。以不结球白菜SW-13×L-118的品种间杂交(‘寒笑’)后代所获得的127个DH系为作图群体,构建了一张不结球白菜分子标记遗传连锁图谱。共筛选2255个引物(组合),其中有512个在双亲间稳定表现多态性,这些多态性引物在群体中共产生的614个多态性标记。卡方检测结果表明有42.67%的多态性标记偏离孟德尔分离比。对所有的多态性标记进行连锁分析发现,有43.49%的多态性标记没能连在任何一个连锁群上。通过在BraassicaA基因组参照图谱中公共的36个SSR标记将连锁群与其10条染色体相关联。通过去除那些与上一标记间距小于1 cM的标记,使图谱质量得到提高。图谱上共包含有268个分子标记,分别是169个SRAP标记、50个SSR标记和49个RAPD标记。图谱总长为973.38 cM,标记间平均距离为3.63 cM。每个连锁群上的标记数目各不相同,A7上的标记数目最多,多达64个,而A8上的标记数目最少,只有18个。每个连锁群的标记间平均距离也各不相同,A7上的标记密度最大,平均图距仅1.70 cM,而A6上的标记密度最小,平均图距为6.71 cM。在A5和A7连锁群上分别有1个大于20 cM的标记空白区。偏分离标记多集中分布在图谱中的某些区域,在连锁群A3、A5、A7、A8和A9上的偏分离标记全部偏向父本,而在连锁群A1、A4和A6上的偏分离标记全部偏向母本。连锁群A2和A10上既有偏向父本的又有偏向母本的标记。以不结球白菜SW-13×V-126的品种间杂交(‘矮抗5号’)后代所获得的117个DH系为作图群体,构建了另一张不结球白菜遗传图谱。共筛选2711对引物组合,其中有381对在双亲间稳定表现多态性,这些多态性引物在群体中共产生的514个多态性标记。卡方检测结果表明有50.19%的多态性标记偏离孟德尔分离比。对所有的多态性标记进行连锁分析发现,有32.88%的多态性标记没能连在任何一个连锁群上。通过在Braassica A基因组参照图谱中公共的59个SSR标记将连锁群与其10条染色体相关联。图谱上共包含345个分子标记,分别是278个SRAP标记和67个SSR标记。图谱总长为936.28 cM,标记间平均距离为2.71 cM。每个连锁群上的标记数目各不相同,A7上的标记数目最多,多达44个,而A10上的标记数目最少,只有20个。每个连锁群的标记间平均距离也各不相同,A7上的标记密度最大,平均图距仅1.90 cM,而R10上的标记密度最小,平均图距为3.58 cM。仅在A6连锁群上有1个标记间距大于20 cM的空白。图谱中包括有42.32%的偏分离标记,在连锁群上聚集分布。利用已构建的不结球白菜‘矮抗5号’DH群体及其分子标记遗传连锁图谱,采用复合区间作图法,分别于播种后40 d和89 d对叶片和叶柄的硝酸盐含量进行QTL定位。共在5个连锁群上的7个标记区间检测到控制不结球白菜硝酸盐含量的11个QTL,其中4个QTL控制播种后40 d叶片硝酸盐含量,3个QTL控制播种后80 d叶片硝酸盐含量,3个QTL控制播种后40 d叶柄硝酸盐含量,1个QTL控制播种后80 d叶柄硝酸盐含量。另外,估算了单个QTL的贡献率和加性效应,发现各QTL的加性效应各不相等,各位点的贡献率在7.73%-19.44%之间。贡献率最高的QTL (NC8-1)在A8上,控制40 d叶片的硝酸盐含量,解释19.44%的表型变异。部分QTL位点在不同指标中被多次检测到。这些定位到的QTL为不结球白菜低硝酸盐遗传育种提供了理论基础。利用不结球白菜‘矮抗5号’DH群体在已构建的连锁图谱上采用复合区间作图法,对不结球白菜13个经济性状进行QTL定位和遗传效应研究。在10个连锁群上共检测到47个QTL,其中控制株高的有2个QTL,控制单株重的有8个QTL,控制叶片重的有3个QTL,控制叶柄重的有9个QTL,控制短缩茎重的有2个QTL,控制菜头粗度的有2个QTL,控制腰粗度的有4个QTL,控制叶数的有1个QTL,控制叶片长度的有4个QTL,控制叶片宽度的有6个QTL,控制叶柄长度的有3个QTL,控制叶柄下宽度的有2个QTL,控制叶柄厚的有2个QTL。各QTL的贡献率在7.93%-25.88%之间,加性效应各异。相关性状QTL的位置往往集中在连锁群上相同或相近的区域。这些定位到的QTL为不结球白菜主要经济性状分子标记辅助选择提供了理论基础。基于不结球白菜‘暑绿’DH群体及其分子遗传图谱,分别于2006年和2007年在不结球白菜收获前的8个不同发育时期进行株高性状调查。利用条件变量分析法,运用QGAStation软件,计算t-1时期到t时期的株高净增长量数据。采用复合区间作图结合混合遗传模型方法,同时检测与株高有关的非条件QTL和条件QTL。两年中,在6个连锁群上共检测到11个控制株高的非条件QTL,在8个连锁群上共检测到23个控制株高的条件QTL。在不同的测定时期,QTL的数目、类型及其遗传效应各异。单个QTL的贡献率在7.92%-28.25%之间。其中有两个QTL(PH8-4和PH8-5)在两年用两种方法都能被检测到。本结果表明结合非条件QTL和条件QTL分析方法能高效地进行发育性状QTL定位。
其他文献
最近,作为高性能运动轿车的代表,大众GTI终于驶入了中国。这次进入中国市场的大众GTI,是大众最新一代产品。其时尚而运动的外型和内饰秉承了大众高性能汽车的一贯的传统。发动机
继酒精饮料、欧式面包后,喜茶又增加新品类了,开始卖咖啡。3月22日,喜茶上线4款咖啡饮品,初期仅在北京君太百货DP店、深圳万象城黑金店、广州惠福东热麦店、上海湖滨道热麦店
随着新《环保法》的实施,各地纷纷严格划定畜牧业的禁、限养区,按照"禁养区全面退养、限养区只减不增、宜养区生态发展"的要求,强势推进畜禽养殖场污染集中整治行动。但这给养
针对新型抽锭电渣重熔工艺,基于金属-热-力多物理场耦合理论框架,建立了抽锭冷却过程的数值分析模型,讨论了尺寸为120 mm电渣锭在冷却过程中的温度场、组织场和应力场的演
表面粗糙度用于描述零件表面微观几何形貌特征,对零件的设计加工和使用性能判别具有重要意义。传统的接触式测量方法会对被测表面造成损伤,且时间效率低。且传统的二维表面粗